Add voltage collages to BluePyMM

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評価

難易度
4/5
見積もり時間
3〜5日
初心者へのやさしさ
35/100
issue の種類
機能追加
明瞭さ
おおむね明確
活発さ
停滞
技術スタック
python

調査の方向性

ファイルもテストも指定されていません。まず、サンプルセルの電圧トレースを生成する BluePyMM ワークフローをたどり、次に、閾値電流と保持電流の再注入をどこに追加できるか、またコラージュをどのように生成すべきかを判断します。代表的な新皮質の出力を、失敗や eFEL アーティファクトがないか目視でレビューできれば完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

We should add a step that generates voltage collages of the traces generated by a sample of the cells.

E.g. for neocortex it would be useful to reinject the threshold / holding current in the cells and plot the output.

This way a human can check if everything is working correctly. (and if e.g. eFEL is not creating any weird artifacts)

主要言語
Python
スター
13
フォーク
9
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

コントリビューションガイド

このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

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