microbiome/OMA

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Orchestrating Microbiome Analysis

¿Es microbiome/OMA apto para principiantes?

Hemos visto muy pocos pull requests recientes de colaboradores externos en microbiome/OMA para saber con qué frecuencia se fusionan. Ahora mismo hay 3 issues aptos para principiantes abiertos.

Estrellas
112
Forks
59
Issues abiertos para principiantes
3
Issues indexados
49
Merge medio
2 d 6 h
PR fusionados (30 d)
8
Lenguaje dominante
TeX
Licencia
Sin datos de licencia
Último push a GitHub
17/10/2026
Última indexación
19/10/2026
Sin guía de contribución
Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes
good first issue

Cómo contribuir a microbiome/OMA

  1. No hay guía de contribución, así que empieza por el README y por algunos pull requests fusionados hace poco para ver cómo se proponen los cambios.
  2. Incluye un Dockerfile o un archivo de Docker Compose, así que puedes ejecutarlo sin instalar todas sus herramientas.
  3. Elige uno de los 3 issues abiertos aptos para principiantes de abajo y comenta que quieres trabajar en él antes de empezar.
Para principiantes Todo
Abierto Todos

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

  • RPCA vs. rarefaction reference
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

    microbiome/OMA#911 ·

  • Multi-omics chapters
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#909 · 4 comentarios ·

  • tidyplots
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    microbiome/OMA#906 ·

  • Bioc book instructions
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#867 ·

  • PERMANOVA final output table
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

    microbiome/OMA#863 ·

  • Data-leakage in ML examples
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    G2: AI

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 52/100

    microbiome/OMA#861 ·

  • Some code is too complex
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 52/100

    microbiome/OMA#859 ·

  • Two book versions now
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#856 · 6 comentarios · 1 asignado ·

  • Use of r2u Docker images to speed up image building
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100

    microbiome/OMA#845 · 1 comentario ·

  • GitHub Actions failure
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#828 · 4 comentarios ·

  • Improve rarefaction docs: move explanation earlier & show `niter` usage for alpha/beta diversity
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    documentation enhancement G4: adoption good first issue

    Dificultad 2/5 Medio día Aptitud para principiantes 82/100

    microbiome/OMA#823 ·

  • Association chapter
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#815 ·

  • Chapter 18 overlap with network chapters
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#814 · 3 comentarios ·

  • mikropml update
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    G2: AI

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

    microbiome/OMA#803 · 12 comentarios ·

  • Docker - GenomeInfoDb
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

    microbiome/OMA#790 ·

  • Enforce certain code styling across the book
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

    microbiome/OMA#780 · 4 comentarios ·

  • Transformation recommendations
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    microbiome/OMA#779 · 2 comentarios ·

  • Time series chapters
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#774 · 2 comentarios ·

  • Inconsistent filenames in Docker image in relation to OMA book
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

    microbiome/OMA#769 · 4 comentarios ·

  • Diversity and taxonomy level + transformation
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

    microbiome/OMA#767 · 2 comentarios ·

  • migration of 'Tools-Microbiome-Analysis' web resource to OMA
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    documentation enhancement G4: adoption

    microbiome/OMA#756 · 2 comentarios · 1 asignado ·

  • ReducedExperiment
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 55/100

    microbiome/OMA#748 · 2 comentarios ·

  • Add a better example of agglomerateByVariable usage
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 58/100

    microbiome/OMA#740 · 6 comentarios ·

  • References to DAA chapter
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#687 · 5 comentarios · 1 asignado ·

  • Develop Carpentries tutorial?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    G4: adoption

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#650 ·

  • Ordination methods, interpretation
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 Medio día Aptitud para principiantes 45/100

    microbiome/OMA#511 · 3 comentarios ·

  • Update Multi-omics chapter to use SE/TSE framework
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#477 ·

  • QMP example data
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#470 · 2 comentarios · 2 asignados ·

  • Integrate new multiomic chapters in the book view
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

    microbiome/OMA#437 · 2 comentarios ·

  • Use a different MAE data for more meaningful MOFA results
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#321 · 1 comentario ·

  • Compare to OSCA & OSTA books
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#272 · 4 comentarios · 1 asignado ·

  • Nice table examples
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#250 · 1 asignado ·

  • Relation between OMA tutorial and website?
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#247 · 4 comentarios · 2 asignados ·

  • Accessible color palettes as the recommended default for OMA
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

    microbiome/OMA#197 · 1 comentario ·

  • neatmap / neatsort
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#146 · 25 comentarios · 2 asignados ·

  • Heatmap tools in SEtools package
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#127 · 5 comentarios · 2 asignados ·

  • batch effects
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#13 · 3 comentarios · 1 asignado ·

  • IntegratedLearner chapter uses the removed `IntegratedLearnerFromMAE()`
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    microbiome/OMA#902 · 1 asignado ·

  • Clarification for ML data preprocessing
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    G2: AI

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#860 ·

  • Confusion/Error on filtering out zero-variance features
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

    microbiome/OMA#822 ·

  • Clarification for IntegratedLearner preprocessing
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    G2: AI

    Dificultad 1/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

    microbiome/OMA#817 ·

  • Citations to open data resources
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 28/100

    microbiome/OMA#816 · 2 comentarios · 1 reacción ·

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