microbiome

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

• RPCA vs. rarefaction reference

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

  microbiome/OMA#911 · Abierto el 4/11/2026

• Multi-omics chapters

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#909 · 4 comentarios · Abierto el 26/10/2026

• tidyplots

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  microbiome/OMA#906 · Abierto el 22/10/2026

• Bioc book instructions

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#867 · Abierto el 8/7/2026

• PERMANOVA final output table

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

  microbiome/OMA#863 · Abierto el 11/6/2026

• Data-leakage in ML examples

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  G2: AI

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 52/100

  microbiome/OMA#861 · Abierto el 8/6/2026

• Some code is too complex

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 52/100

  microbiome/OMA#859 · Abierto el 2/6/2026

• Two book versions now

  Quizá libre de nuevo @0xMuluh la tomó hace 119 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#856 · 6 comentarios · 1 asignado · Abierto el 12/5/2026

• Use of r2u Docker images to speed up image building

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100

  microbiome/OMA#845 · 1 comentario · Abierto el 25/2/2026

• GitHub Actions failure

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#828 · 4 comentarios · Abierto el 14/1/2026

• Improve rarefaction docs: move explanation earlier & show `niter` usage for alpha/beta diversity

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  documentation enhancement G4: adoption good first issue

  Dificultad 2/5 Medio día Aptitud para principiantes 82/100

  microbiome/OMA#823 · Abierto el 23/11/2025

• Association chapter

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#815 · Abierto el 23/9/2025

• Chapter 18 overlap with network chapters

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#814 · 3 comentarios · Abierto el 23/9/2025

• mikropml update

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  G2: AI

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

  microbiome/OMA#803 · 12 comentarios · Abierto el 11/9/2025

• Docker - GenomeInfoDb

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

  microbiome/OMA#790 · Abierto el 21/8/2025

• Enforce certain code styling across the book

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

  microbiome/OMA#780 · 4 comentarios · Abierto el 7/8/2025

• Transformation recommendations

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

  microbiome/OMA#779 · 2 comentarios · Abierto el 6/8/2025

• Time series chapters

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#774 · 2 comentarios · Abierto el 4/8/2025

• Inconsistent filenames in Docker image in relation to OMA book

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

  microbiome/OMA#769 · 4 comentarios · Abierto el 15/7/2025

• Diversity and taxonomy level + transformation

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

  microbiome/OMA#767 · 2 comentarios · Abierto el 14/7/2025

• migration of 'Tools-Microbiome-Analysis' web resource to OMA

  Quizá libre de nuevo @TuomasBorman la tomó hace 500 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  documentation enhancement G4: adoption

  microbiome/OMA#756 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 20/6/2025

• ReducedExperiment

  Quizá libre de nuevo @Sadia12345 la tomó hace 15 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 55/100

  microbiome/OMA#748 · 2 comentarios · Abierto el 29/5/2025

• Add a better example of agglomerateByVariable usage

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 58/100

  microbiome/OMA#740 · 6 comentarios · Abierto el 22/5/2025

• References to DAA chapter

  Quizá libre de nuevo @0xMuluh la tomó hace 570 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#687 · 5 comentarios · 1 asignado · Abierto el 16/3/2025

• Develop Carpentries tutorial?

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  G4: adoption

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#650 · Abierto el 16/12/2024

• Ordination methods, interpretation

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 Medio día Aptitud para principiantes 45/100

  microbiome/OMA#511 · 3 comentarios · Abierto el 5/6/2024

• Update Multi-omics chapter to use SE/TSE framework

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#477 · Abierto el 6/5/2024

• QMP example data

  Quizá libre de nuevo @ShadmanIshraq la tomó hace 903 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#470 · 2 comentarios · 2 asignados · Abierto el 1/5/2024

• Integrate new multiomic chapters in the book view

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

  microbiome/OMA#437 · 2 comentarios · Abierto el 22/4/2024

• Use a different MAE data for more meaningful MOFA results

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#321 · 1 comentario · Abierto el 4/8/2023

• Compare to OSCA & OSTA books

  Quizá libre de nuevo @antagomir la tomó hace 752 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#272 · 4 comentarios · 1 asignado · Abierto el 5/6/2023

• Nice table examples

  Quizá libre de nuevo @0xMuluh la tomó hace 752 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#250 · 1 asignado · Abierto el 10/4/2023

• Relation between OMA tutorial and website?

  Quizá libre de nuevo @TuomasBorman la tomó hace 821 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#247 · 4 comentarios · 2 asignados · Abierto el 9/4/2023

• Accessible color palettes as the recommended default for OMA

  Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

  microbiome/OMA#197 · 1 comentario · Abierto el 18/11/2022

• neatmap / neatsort

  Quizá libre de nuevo @0xMuluh la tomó hace 821 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#146 · 25 comentarios · 2 asignados · Abierto el 6/2/2022

• Heatmap tools in SEtools package

  Quizá libre de nuevo @TuomasBorman la tomó hace 1760 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#127 · 5 comentarios · 2 asignados · Abierto el 9/1/2022

• batch effects

  Quizá libre de nuevo @antagomir la tomó hace 1938 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#13 · 3 comentarios · 1 asignado · Abierto el 22/2/2021

• IntegratedLearner chapter uses the removed `IntegratedLearnerFromMAE()`

  Posiblemente ocupada @0xMuluh la tomó hace 21 días. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  microbiome/OMA#902 · 1 asignado · Abierto el 15/10/2026

• Clarification for ML data preprocessing

  Posiblemente ocupada @0xMuluh la tomó hace 64 días. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  G2: AI

  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#860 · Abierto el 8/6/2026

• Confusion/Error on filtering out zero-variance features

  Posiblemente ocupada @0xMuluh la tomó hace 64 días. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

  microbiome/OMA#822 · Abierto el 6/11/2025

• Clarification for IntegratedLearner preprocessing

  Posiblemente ocupada @0xMuluh la tomó hace 64 días. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar
  G2: AI

  Dificultad 1/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

  microbiome/OMA#817 · Abierto el 30/9/2025

• Citations to open data resources

  Posiblemente ocupada @raivo-otus la tomó hace 393 días. Abierto

  ⋯Informar de un problema con este issue

  • ¿Algo no está bien?

  • Ya está asignado
  • No es para principiantes
  • Obsoleto o no válido
  • Otra cosa…
  • Enviar Cancelar

  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 28/100

  microbiome/OMA#816 · 2 comentarios · 1 reacción · Abierto el 30/9/2025