microbiome/OMA

Đăng nhập để theo dõi Xem trên GitHub

Orchestrating Microbiome Analysis

microbiome/OMA có thân thiện với người mới không?

Gần đây có quá ít pull request của người đóng góp bên ngoài gửi tới microbiome/OMA để nói chúng được merge thường xuyên đến đâu. Hiện có 2 issue phù hợp với người mới đang mở.

Star
112
Fork
59
Issue cho người mới đang mở
2
Issue đã lập chỉ mục
49
Merge trung bình
2 ngày 6 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
8
Ngôn ngữ chính
TeX
Giấy phép
Không có dữ liệu giấy phép
Lần push lên GitHub gần nhất
17/10/2026
Lập chỉ mục gần nhất
19/10/2026
Không có hướng dẫn đóng góp
Không có quy tắc ứng xử
Label cho người mới
good first issue

Cách đóng góp cho microbiome/OMA

  1. Dự án không có hướng dẫn đóng góp, vì vậy hãy bắt đầu từ README và vài pull request vừa được merge để xem thay đổi được đề xuất thế nào.
  2. Dự án có Dockerfile hoặc tệp Docker Compose, nên bạn có thể chạy nó mà không cần cài cả bộ công cụ.
  3. Chọn một trong 2 issue phù hợp với người mới đang mở bên dưới và bình luận rằng bạn muốn làm nó trước khi bắt đầu.
Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • RPCA vs. rarefaction reference
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100

    microbiome/OMA#911 ·

  • Multi-omics chapters
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#909 · 4 bình luận ·

  • tidyplots
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    microbiome/OMA#906 ·

  • Bioc book instructions
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#867 ·

  • PERMANOVA final output table
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100

    microbiome/OMA#863 ·

  • Data-leakage in ML examples
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    G2: AI

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    microbiome/OMA#861 ·

  • Some code is too complex
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    microbiome/OMA#859 ·

  • Two book versions now
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#856 · 6 bình luận · 1 người được giao ·

  • Use of r2u Docker images to speed up image building
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    microbiome/OMA#845 · 1 bình luận ·

  • GitHub Actions failure
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#828 · 4 bình luận ·

  • Improve rarefaction docs: move explanation earlier & show `niter` usage for alpha/beta diversity
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    documentation enhancement G4: adoption good first issue

    Độ khó 2/5 Nửa ngày Mức phù hợp với người mới 82/100

    microbiome/OMA#823 ·

  • Association chapter
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#815 ·

  • Chapter 18 overlap with network chapters
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#814 · 3 bình luận ·

  • mikropml update
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    G2: AI

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    microbiome/OMA#803 · 12 bình luận ·

  • Docker - GenomeInfoDb
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100

    microbiome/OMA#790 ·

  • Enforce certain code styling across the book
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    microbiome/OMA#780 · 4 bình luận ·

  • Transformation recommendations
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    microbiome/OMA#779 · 2 bình luận ·

  • Time series chapters
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#774 · 2 bình luận ·

  • Inconsistent filenames in Docker image in relation to OMA book
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    microbiome/OMA#769 · 4 bình luận ·

  • Diversity and taxonomy level + transformation
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 55/100

    microbiome/OMA#767 · 2 bình luận ·

  • migration of 'Tools-Microbiome-Analysis' web resource to OMA
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    documentation enhancement G4: adoption

    microbiome/OMA#756 · 2 bình luận · 1 người được giao ·

  • ReducedExperiment
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 55/100

    microbiome/OMA#748 · 2 bình luận ·

  • Add a better example of agglomerateByVariable usage
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 58/100

    microbiome/OMA#740 · 6 bình luận ·

  • References to DAA chapter
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#687 · 5 bình luận · 1 người được giao ·

  • Develop Carpentries tutorial?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    G4: adoption

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#650 ·

  • Ordination methods, interpretation
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 Nửa ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    microbiome/OMA#511 · 3 bình luận ·

  • Update Multi-omics chapter to use SE/TSE framework
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#477 ·

  • QMP example data
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#470 · 2 bình luận · 2 người được giao ·

  • Integrate new multiomic chapters in the book view
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    microbiome/OMA#437 · 2 bình luận ·

  • Use a different MAE data for more meaningful MOFA results
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#321 · 1 bình luận ·

  • Compare to OSCA & OSTA books
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#272 · 4 bình luận · 1 người được giao ·

  • Nice table examples
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#250 · 1 người được giao ·

  • Relation between OMA tutorial and website?
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#247 · 4 bình luận · 2 người được giao ·

  • Accessible color palettes as the recommended default for OMA
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    microbiome/OMA#197 · 1 bình luận ·

  • neatmap / neatsort
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#146 · 25 bình luận · 2 người được giao ·

  • Heatmap tools in SEtools package
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#127 · 5 bình luận · 2 người được giao ·

  • batch effects
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#13 · 3 bình luận · 1 người được giao ·

  • IntegratedLearner chapter uses the removed `IntegratedLearnerFromMAE()`
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?

    microbiome/OMA#902 · 1 người được giao ·

  • Clarification for ML data preprocessing
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?
    G2: AI

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#860 ·

  • Confusion/Error on filtering out zero-variance features
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    microbiome/OMA#822 ·

  • Clarification for IntegratedLearner preprocessing
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?
    G2: AI

    Độ khó 1/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    microbiome/OMA#817 ·

  • Citations to open data resources
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 28/100

    microbiome/OMA#816 · 2 bình luận · 1 reaction ·

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.