ClawBio

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 72/100

  ClawBio/ClawBio#692 · Erstellt am 21.10.2026

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• ukb-ppp-region-fetch: where does the EUR sample size of 46,673 come from?

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

  ClawBio/ClawBio#691 · Erstellt am 21.10.2026

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• [Documentation] seq-wrangler: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 78/100

  ClawBio/ClawBio#689 · Erstellt am 21.10.2026

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• [Documentation] nfcore-scrnaseq-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 78/100

  ClawBio/ClawBio#688 · Erstellt am 21.10.2026

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• [Documentation] nfcore-sarek-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#687 · Erstellt am 21.10.2026

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• [Documentation] nfcore-rnastructurome-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 76/100

  ClawBio/ClawBio#686 · Erstellt am 21.10.2026

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• [Documentation] nfcore-rnaseq-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#685 · Erstellt am 21.10.2026

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• Should wgs-prs run sarek through nfcore-sarek-wrapper?

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  question

  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 12/100

  ClawBio/ClawBio#644 · Erstellt am 16.10.2026

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• Should pubmed-summariser and lit-synthesizer be merged?

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

  ClawBio/ClawBio#642 · 3 Kommentare · Erstellt am 16.10.2026

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• Retire `skill-builder`: the catalog routes "new skill" to a generator that produces non-conformant SKILL.md files

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  Schwierigkeit 3/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 42/100

  ClawBio/ClawBio#551 · Erstellt am 08.10.2026

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• [Skill] Public genomic archive retrieval with Genomics MCP

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 18/100

  ClawBio/ClawBio#501 · Erstellt am 28.9.2026

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• Repo cleanup

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 15/100

  ClawBio/ClawBio#484 · Erstellt am 25.9.2026

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• preferred_artifacts type vocabulary: open with a UI fallback, or fixed and documented?

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

  ClawBio/ClawBio#440 · Erstellt am 16.9.2026

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• nutrigx: four judgement calls on panel membership and provenance, raised rather than patched

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

  ClawBio/ClawBio#429 · Erstellt am 12.9.2026

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• Reproducibility bundles are optional by construction: 34 skills have none, 18 created after the shared layer landed

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  documentation enhancement P2

  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 12/100

  ClawBio/ClawBio#372 · 1 Kommentar · Erstellt am 29.8.2026

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• CI never runs on R and shell skills: no workflow run has ever existed for #329

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

  ClawBio/ClawBio#360 · 4 Kommentare · Erstellt am 22.8.2026

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• Two skills need a licence decision: rare-disease-rnaseq (none declared) and fastreer (GPL-3.0)

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  Schwierigkeit 3/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 22/100

  ClawBio/ClawBio#340 · Erstellt am 13.8.2026

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• Encode recurring domain failure classes as ClawBench CI gates (scanner passes scientifically-wrong skill PRs)

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

  ClawBio/ClawBio#313 · 1 Kommentar · Erstellt am 04.7.2026

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• Help wanted: add more nf-core pipeline wrappers (3 implemented, ~150 available)

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  Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 50/100

  ClawBio/ClawBio#277 · Erstellt am 31.5.2026

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• Continue rollout of shared reproducibility API across remaining skills

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

  ClawBio/ClawBio#226 · Erstellt am 04.5.2026

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• FAIRification of ClawBio skills

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  ClawBio/ClawBio#107 · 4 Kommentare · Erstellt am 05.4.2026

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• Remediation: clawbio_bench external audit findings (80/140 passing)

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  Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 22/100

  ClawBio/ClawBio#106 · 3 Kommentare · Erstellt am 05.4.2026

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• Validate real ICA metadata enrichment in illumina-bridge

  Offen

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

  ClawBio/ClawBio#74 · 2 Kommentare · Erstellt am 20.3.2026

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• [Documentation] clinical-trial-finder: example output and README predate the shared reproducibility/ layout

  Evtl. vergeben @sooraj-codes hat das vor 5 Tagen übernommen. Offen

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  bug

  Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 70/100

  ClawBio/ClawBio#630 · 1 Kommentar · Erstellt am 15.10.2026

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• pharmgx-reporter: detected DPYD*2A with HapB3 untested should report at least IM, not Indeterminate

  Evtl. vergeben @manuelcorpas hat das vor 8 Tagen übernommen. Offen

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  ClawBio/ClawBio#602 · Erstellt am 13.10.2026

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• pharmgx-reporter: methotrexate graded on MTHFR genotype without a CPIC basis; labels overstate activity

  Evtl. vergeben @abotescu20-maker hat das vor 9 Tagen übernommen. Offen

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

  ClawBio/ClawBio#594 · Erstellt am 12.10.2026

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• wgs-prs: --demo fails at VCF QC on bcftools 1.23 (demo VCF header has no ##contig lines)

  Evtl. vergeben @ShryukGrandhi hat das vor 1 Tag übernommen. Offen

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  help wanted

  Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 85/100

  ClawBio/ClawBio#568 · Erstellt am 09.10.2026

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• [Skill] scrna-embedding-audit: score cell embeddings against an in-run PCA baseline (first of a foundation-model series)

  Evtl. vergeben @krudo-taco hat das vor 16 Tagen übernommen. Offen

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  Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 15/100

  ClawBio/ClawBio#541 · 3 Kommentare · Erstellt am 05.10.2026

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