ClawBio

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• locuscompare-region-render: duplicate eQTL Catalogue rows are paired twice (SORT1 golden: 2,547 pairs, 2,487 unique)

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 72/100

  ClawBio/ClawBio#692 · 2026年10月21日 に作成

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• ukb-ppp-region-fetch: where does the EUR sample size of 46,673 come from?

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 55/100

  ClawBio/ClawBio#691 · 2026年10月21日 に作成

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• [Documentation] seq-wrangler: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 78/100

  ClawBio/ClawBio#689 · 2026年10月21日 に作成

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• [Documentation] nfcore-scrnaseq-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#688 · 2026年10月21日 に作成

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• [Documentation] nfcore-sarek-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#687 · 2026年10月21日 に作成

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• [Documentation] nfcore-rnastructurome-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 76/100

  ClawBio/ClawBio#686 · 2026年10月21日 に作成

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• [Documentation] nfcore-rnaseq-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#685 · 2026年10月21日 に作成

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• Should wgs-prs run sarek through nfcore-sarek-wrapper?

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  question

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 12/100

  ClawBio/ClawBio#644 · 2026年10月16日 に作成

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• Should pubmed-summariser and lit-synthesizer be merged?

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  question

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

  ClawBio/ClawBio#642 · コメント 3 件 · 2026年10月16日 に作成

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• Retire `skill-builder`: the catalog routes "new skill" to a generator that produces non-conformant SKILL.md files

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  難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 42/100

  ClawBio/ClawBio#551 · 2026年10月8日 に作成

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• [Skill] Public genomic archive retrieval with Genomics MCP

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 18/100

  ClawBio/ClawBio#501 · 2026年9月28日 に作成

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• Repo cleanup

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  ClawBio/ClawBio#484 · 2026年9月25日 に作成

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• preferred_artifacts type vocabulary: open with a UI fallback, or fixed and documented?

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  ClawBio/ClawBio#440 · 2026年9月16日 に作成

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• nutrigx: four judgement calls on panel membership and provenance, raised rather than patched

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  ClawBio/ClawBio#429 · 2026年9月12日 に作成

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• Reproducibility bundles are optional by construction: 34 skills have none, 18 created after the shared layer landed

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  documentation enhancement P2

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 12/100

  ClawBio/ClawBio#372 · コメント 1 件 · 2026年8月29日 に作成

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• CI never runs on R and shell skills: no workflow run has ever existed for #329

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

  ClawBio/ClawBio#360 · コメント 4 件 · 2026年8月22日 に作成

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• Two skills need a licence decision: rare-disease-rnaseq (none declared) and fastreer (GPL-3.0)

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  難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 22/100

  ClawBio/ClawBio#340 · 2026年8月13日 に作成

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• Encode recurring domain failure classes as ClawBench CI gates (scanner passes scientifically-wrong skill PRs)

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  ClawBio/ClawBio#313 · コメント 1 件 · 2026年7月4日 に作成

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• Help wanted: add more nf-core pipeline wrappers (3 implemented, ~150 available)

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 50/100

  ClawBio/ClawBio#277 · 2026年5月31日 に作成

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• Continue rollout of shared reproducibility API across remaining skills

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  ClawBio/ClawBio#226 · 2026年5月4日 に作成

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• FAIRification of ClawBio skills

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  ClawBio/ClawBio#107 · コメント 4 件 · 2026年4月5日 に作成

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• Remediation: clawbio_bench external audit findings (80/140 passing)

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  ClawBio/ClawBio#106 · コメント 3 件 · 2026年4月5日 に作成

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• Validate real ICA metadata enrichment in illumina-bridge

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  ClawBio/ClawBio#74 · コメント 2 件 · 2026年3月20日 に作成

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• [Documentation] clinical-trial-finder: example output and README predate the shared reproducibility/ layout

  対応中かも @sooraj-codes が 5 日前に担当しました。 オープン

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  bug

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 70/100

  ClawBio/ClawBio#630 · コメント 1 件 · 2026年10月15日 に作成

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• pharmgx-reporter: detected DPYD*2A with HapB3 untested should report at least IM, not Indeterminate

  対応中かも @manuelcorpas が 8 日前に担当しました。 オープン

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  ClawBio/ClawBio#602 · 2026年10月13日 に作成

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• pharmgx-reporter: methotrexate graded on MTHFR genotype without a CPIC basis; labels overstate activity

  対応中かも @abotescu20-maker が 9 日前に担当しました。 オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  ClawBio/ClawBio#594 · 2026年10月12日 に作成

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• wgs-prs: --demo fails at VCF QC on bcftools 1.23 (demo VCF header has no ##contig lines)

  対応中かも @ShryukGrandhi が 1 日前に担当しました。 オープン

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  help wanted

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 85/100

  ClawBio/ClawBio#568 · 2026年10月9日 に作成

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• [Skill] scrna-embedding-audit: score cell embeddings against an in-run PCA baseline (first of a foundation-model series)

  対応中かも @krudo-taco が 16 日前に担当しました。 オープン

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  ClawBio/ClawBio#541 · コメント 3 件 · 2026年10月5日 に作成

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