ClawBio

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  ClawBio/ClawBio#692 · Aperta il 21/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• ukb-ppp-region-fetch: where does the EUR sample size of 46,673 come from?

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  ClawBio/ClawBio#691 · Aperta il 21/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• [Documentation] seq-wrangler: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#689 · Aperta il 21/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• [Documentation] nfcore-scrnaseq-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#688 · Aperta il 21/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• [Documentation] nfcore-sarek-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#687 · Aperta il 21/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• [Documentation] nfcore-rnastructurome-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#686 · Aperta il 21/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• [Documentation] nfcore-rnaseq-wrapper: fold README.md into SKILL.md and remove it

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  ClawBio/ClawBio#685 · Aperta il 21/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Should wgs-prs run sarek through nfcore-sarek-wrapper?

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  question

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  ClawBio/ClawBio#644 · Aperta il 16/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Should pubmed-summariser and lit-synthesizer be merged?

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  ClawBio/ClawBio#642 · 3 commenti · Aperta il 16/10/2026

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• Retire `skill-builder`: the catalog routes "new skill" to a generator that produces non-conformant SKILL.md files

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  ClawBio/ClawBio#551 · Aperta il 8/10/2026

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• [Skill] Public genomic archive retrieval with Genomics MCP

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  ClawBio/ClawBio#501 · Aperta il 28/9/2026

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• Repo cleanup

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  ClawBio/ClawBio#484 · Aperta il 25/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• preferred_artifacts type vocabulary: open with a UI fallback, or fixed and documented?

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  ClawBio/ClawBio#440 · Aperta il 16/9/2026

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• nutrigx: four judgement calls on panel membership and provenance, raised rather than patched

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  ClawBio/ClawBio#429 · Aperta il 12/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Reproducibility bundles are optional by construction: 34 skills have none, 18 created after the shared layer landed

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  documentation enhancement P2

  Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 12/100

  ClawBio/ClawBio#372 · 1 commento · Aperta il 29/8/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• CI never runs on R and shell skills: no workflow run has ever existed for #329

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  ClawBio/ClawBio#360 · 4 commenti · Aperta il 22/8/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Two skills need a licence decision: rare-disease-rnaseq (none declared) and fastreer (GPL-3.0)

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  Difficoltà 3/5 Mezza giornata Idoneità per principianti 22/100

  ClawBio/ClawBio#340 · Aperta il 13/8/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Encode recurring domain failure classes as ClawBench CI gates (scanner passes scientifically-wrong skill PRs)

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  ClawBio/ClawBio#313 · 1 commento · Aperta il 4/7/2026

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• Help wanted: add more nf-core pipeline wrappers (3 implemented, ~150 available)

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  ClawBio/ClawBio#277 · Aperta il 31/5/2026

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• Continue rollout of shared reproducibility API across remaining skills

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  ClawBio/ClawBio#226 · Aperta il 4/5/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• FAIRification of ClawBio skills

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  ClawBio/ClawBio#107 · 4 commenti · Aperta il 5/4/2026

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• Remediation: clawbio_bench external audit findings (80/140 passing)

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  ClawBio/ClawBio#106 · 3 commenti · Aperta il 5/4/2026

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• Validate real ICA metadata enrichment in illumina-bridge

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  ClawBio/ClawBio#74 · 2 commenti · Aperta il 20/3/2026

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• [Documentation] clinical-trial-finder: example output and README predate the shared reproducibility/ layout

  Forse già presa @sooraj-codes l’ha presa 5 giorni fa. Aperta

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  bug

  Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 70/100

  ClawBio/ClawBio#630 · 1 commento · Aperta il 15/10/2026

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• pharmgx-reporter: detected DPYD*2A with HapB3 untested should report at least IM, not Indeterminate

  Forse già presa @manuelcorpas l’ha presa 8 giorni fa. Aperta

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  ClawBio/ClawBio#602 · Aperta il 13/10/2026

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• pharmgx-reporter: methotrexate graded on MTHFR genotype without a CPIC basis; labels overstate activity

  Forse già presa @abotescu20-maker l’ha presa 9 giorni fa. Aperta

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  ClawBio/ClawBio#594 · Aperta il 12/10/2026

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• wgs-prs: --demo fails at VCF QC on bcftools 1.23 (demo VCF header has no ##contig lines)

  Forse già presa @ShryukGrandhi l’ha presa 1 giorno fa. Aperta

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  help wanted

  Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 85/100

  ClawBio/ClawBio#568 · Aperta il 9/10/2026

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• [Skill] scrna-embedding-audit: score cell embeddings against an in-run PCA baseline (first of a foundation-model series)

  Forse già presa @krudo-taco l’ha presa 16 giorni fa. Aperta

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  ClawBio/ClawBio#541 · 3 commenti · Aperta il 5/10/2026

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