Check ITS Taxon data
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评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 25/100
- Issue 类型
- 功能
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 停滞
- 技术栈
- r
调研方向
Start with the ITS Blast sequence read file and select sequences from identified taxa, including taxa with multiple OTUs for one species. Save the BLAST results, check whether they indicate multiple possible species, and compare them with trnL BLASTs from species-identified OTUs, including their cutoffs.
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
-
Submit sequences for some of the identified taxon in the ITS Blast sequence read file and save results. (Include some of the sequences where a single species has multiple OTUs associated with it
-
Check if these results give more than one possible species
-
Check these results against some trnL BLASTs using OTUs in our data identified to species. Are similar cutoffs being used?
- 主要语言
- R
- 星标
- 0
- 派生
- 1
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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