Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

Check ITS Taxon data

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#5 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
25/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
r
Lĩnh vực
bioinformatics

Hướng nghiên cứu

Start with the ITS Blast sequence read file and select sequences from identified taxa, including taxa with multiple OTUs for one species. Save the BLAST results, check whether they indicate multiple possible species, and compare them with trnL BLASTs from species-identified OTUs, including their cutoffs.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

  • Submit sequences for some of the identified taxon in the ITS Blast sequence read file and save results. (Include some of the sequences where a single species has multiple OTUs associated with it

  • Check if these results give more than one possible species

  • Check these results against some trnL BLASTs using OTUs in our data identified to species. Are similar cutoffs being used?

Ngôn ngữ chính
R
Star
0
Fork
1
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của weecology/Metabarcoding

Tất cả issue của weecology/Metabarcoding

Issue tương tự

Thêm issue về R

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.