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Maybe support stats for `anndata.abc.CS*Dataset` with anndata 0.12

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评估

难度
3/5
预计耗时
1-2 天
新手友好度
38/100
Issue 类型
功能
描述清晰度
基本清楚
活跃度
停滞
技术栈
numpy, python
领域
data

调研方向

未指定文件或测试。请从 anndata.settings.override(use_sparse_array_on_read=True) 示例开始,检查针对 anndata.abc.CS*Dataset 的 np.sum、mean 和 mean_var 的现有处理;完成的标准是受支持的统计量可用于该数据集类型。

由索引模型根据 Issue 内容生成。

描述

type: disk

We might be able to run sum, mean, and maybe even mean_var on it with sparrays:

with anndata.settings.override(use_sparse_array_on_read=True):
    return np.sum(sds)
主要语言
Python
星标
15
派生
5
平均合并
10 小时 24 分钟
30 天内合并 PR
12

环境准备

我们还没有检查这个项目的环境配置文件。先看它的 README,通用步骤见我们的新手贡献指南。

从这里开始

  1. 先读完整个 Issue,再读项目的贡献指南。
  2. 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
  3. Fork 仓库,在一个分支上完成修改。
  4. 提交 Pull Request,并在描述里引用这个 Issue 编号。

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