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Maybe support stats for `anndata.abc.CS*Dataset` with anndata 0.12

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
38/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
numpy, python
Ambito
data

Direzione di ricerca

Non sono indicati file o test. Parti dall’esempio anndata.settings.override(use_sparse_array_on_read=True) e ispeziona la gestione esistente di np.sum, mean e mean_var per anndata.abc.CS*Dataset; il lavoro è completato quando le statistiche supportate funzionano per quel tipo di dataset.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

type: disk

We might be able to run sum, mean, and maybe even mean_var on it with sparrays:

with anndata.settings.override(use_sparse_array_on_read=True):
    return np.sum(sds)
Lingua principale
Python
Stelle
15
Fork
5
Merge medio
10h 33m
PR unite (30g)
9

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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