Maybe support stats for `anndata.abc.CS*Dataset` with anndata 0.12
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評価
調査の方向性
ファイルやテストは指定されていません。anndata.settings.override(use_sparse_array_on_read=True) の例から始め、anndata.abc.CS*Dataset に対する np.sum、mean、mean_var の既存の処理を調査してください。対応する統計量がそのデータセット型で動作すれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
We might be able to run sum, mean, and maybe even mean_var on it with sparrays:
with anndata.settings.override(use_sparse_array_on_read=True):
return np.sum(sds)
- 主要言語
- Python
- スター
- 15
- フォーク
- 5
- 平均マージ
- 10時間 24分
- マージ済み PR(30日)
- 12
環境構築
このプロジェクトの環境構築ファイルはまだ確認していません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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