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Make cookbook materials fetchables

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评估

难度
4/5
预计耗时
3-5 天
新手友好度
35/100
Issue 类型
功能
描述清晰度
基本清楚
活跃度
停滞
技术栈
jupyter-notebook
领域
cli, documentation

调研方向

先从 openfecli/fetchables.py 开始，查看现有的可获取资源模式，然后检查 cookbook notebooks 以及 issue 中提到的重复输入文件。在修改 notebook 设置行之前，协调 OpenFE 的发布和 ExampleNotebooks 中的版本更新。所需的 cookbook 输入能够通过 OpenFE 下载，并且单个 notebook 无需克隆仓库或 tarball 即可运行，即表示完成。

由索引模型根据 Issue 内容生成。

描述

Follow-up on #84: There should be a single source of truth for cookbook input files (SDFs, PDBs, etc.) instead of having a copy in, e.g., the OpenFE test suite, with a duplicate stored here.

We could then make the first line of each notebook be ! openfe fetch cookbook-files — this could be either a fetchable per-notebook or a single fetchable to download all cookbook notebooks.

This would have the advantage that even a download of a single notebook would be self-contained, instead of requiring users to download a tarball/clone of the repo.

Steps to make this happen:

  1. Create the fetchables in the OpenFE CLI. See fetchables.py for examples
  2. Cut a release of OpenFE, update ExampleNotebooks to use that OpenFE version.
  3. Update the cookbook notebooks here to download the required files.
主要语言
Jupyter Notebook
星标
70
派生
15
平均合并
10 小时 42 分钟
30 天内合并 PR
2

贡献指南

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  1. 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
  2. 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
  3. Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
  4. 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。

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