BiocParallel doesn't propagate warnings
还没有人认领这个 Issue。
评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 42/100
- Issue 类型
- 缺陷
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 停滞
- 技术栈
- r
调研方向
Start by running the R example with bplapply and then trace the bplapply entry point to see where warnings from fun are lost. Done means warnings no longer silently disappear: they should be propagated or accompanied by a message indicating that warnings occurred.
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
This is not ideal imo, means that warnings silently disappear. Would be fine (ish) if at least a message showed up saying we encountered some warnings
library(BiocParallel)
fun <- function(v) {
warning("A warning")
sqrt(v)
}
bplapply(1:10, fun)
#> [[1]]
#> [1] 1
#>
#> [[2]]
#> [1] 1.414214
#>
#> [[3]]
#> [1] 1.732051
#>
#> [[4]]
#> [1] 2
#>
#> [[5]]
#> [1] 2.236068
#>
#> [[6]]
#> [1] 2.44949
#>
#> [[7]]
#> [1] 2.645751
#>
#> [[8]]
#> [1] 2.828427
#>
#> [[9]]
#> [1] 3
#>
#> [[10]]
#> [1] 3.162278
- 主要语言
- R
- 星标
- 69
- 派生
- 32
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
Bioconductor/BiocParallel 的其他 Issue
-
BatchtoolsParam handles reduce.in.order differently from others可能已有人在做 @LeonidasZhak 于 46 天前认领。 未关闭
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 65/100
Bioconductor/BiocParallel#286 · 1 条评论 ·
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 50/100
Bioconductor/BiocParallel#285 ·
-
futile.logger may be archived from CRAN可能重新可做 @Jiefei-Wang 于 283 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
Bioconductor/BiocParallel#284 · 2 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 25/100
Bioconductor/BiocParallel#283 · 2 条评论 ·
-
DoparParam: Captured stdout is relayed to stdout for some foreach adapters and stderr for others未关闭
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
Bioconductor/BiocParallel#277 ·
查看 Bioconductor/BiocParallel 的全部 Issue
相似的 Issue
-
Write an exception for delayed NYC data only可能已有人在做 @kaitejohnson 今天认领。 未关闭
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 74/100
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 78/100
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 76/100
-
New `filter_out()` requires dplyr >= 1.2.0可能已有人在做 @jameslairdsmith 今天认领。 未关闭
难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 74/100
-
难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 78/100