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BiocParallel doesn't propagate warnings

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
42/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
r
Ambito
distributed-systems

Direzione di ricerca

Start by running the R example with bplapply and then trace the bplapply entry point to see where warnings from fun are lost. Done means warnings no longer silently disappear: they should be propagated or accompanied by a message indicating that warnings occurred.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

This is not ideal imo, means that warnings silently disappear. Would be fine (ish) if at least a message showed up saying we encountered some warnings

library(BiocParallel)
fun <- function(v) {
     warning("A warning")
     sqrt(v)
 }
 bplapply(1:10, fun)
#> [[1]]
#> [1] 1
#> 
#> [[2]]
#> [1] 1.414214
#> 
#> [[3]]
#> [1] 1.732051
#> 
#> [[4]]
#> [1] 2
#> 
#> [[5]]
#> [1] 2.236068
#> 
#> [[6]]
#> [1] 2.44949
#> 
#> [[7]]
#> [1] 2.645751
#> 
#> [[8]]
#> [1] 2.828427
#> 
#> [[9]]
#> [1] 3
#> 
#> [[10]]
#> [1] 3.162278
Lingua principale
R
Stelle
69
Fork
32
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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