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BiocParallel doesn't propagate warnings

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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
42/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
r
Área
distributed-systems

Línea de trabajo

Start by running the R example with bplapply and then trace the bplapply entry point to see where warnings from fun are lost. Done means warnings no longer silently disappear: they should be propagated or accompanied by a message indicating that warnings occurred.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

This is not ideal imo, means that warnings silently disappear. Would be fine (ish) if at least a message showed up saying we encountered some warnings

library(BiocParallel)
fun <- function(v) {
     warning("A warning")
     sqrt(v)
 }
 bplapply(1:10, fun)
#> [[1]]
#> [1] 1
#> 
#> [[2]]
#> [1] 1.414214
#> 
#> [[3]]
#> [1] 1.732051
#> 
#> [[4]]
#> [1] 2
#> 
#> [[5]]
#> [1] 2.236068
#> 
#> [[6]]
#> [1] 2.44949
#> 
#> [[7]]
#> [1] 2.645751
#> 
#> [[8]]
#> [1] 2.828427
#> 
#> [[9]]
#> [1] 3
#> 
#> [[10]]
#> [1] 3.162278
Lenguaje dominante
R
Estrellas
69
Forks
32
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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