BiocParallel doesn't propagate warnings
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 42/100
- Loại issue
- Lỗi
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- r
- Lĩnh vực
- distributed-systems
Hướng nghiên cứu
Start by running the R example with bplapply and then trace the bplapply entry point to see where warnings from fun are lost. Done means warnings no longer silently disappear: they should be propagated or accompanied by a message indicating that warnings occurred.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
This is not ideal imo, means that warnings silently disappear. Would be fine (ish) if at least a message showed up saying we encountered some warnings
library(BiocParallel)
fun <- function(v) {
warning("A warning")
sqrt(v)
}
bplapply(1:10, fun)
#> [[1]]
#> [1] 1
#>
#> [[2]]
#> [1] 1.414214
#>
#> [[3]]
#> [1] 1.732051
#>
#> [[4]]
#> [1] 2
#>
#> [[5]]
#> [1] 2.236068
#>
#> [[6]]
#> [1] 2.44949
#>
#> [[7]]
#> [1] 2.645751
#>
#> [[8]]
#> [1] 2.828427
#>
#> [[9]]
#> [1] 3
#>
#> [[10]]
#> [1] 3.162278
- Ngôn ngữ chính
- R
- Star
- 69
- Fork
- 32
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của Bioconductor/BiocParallel
-
BatchtoolsParam handles reduce.in.order differently from othersCó thể đã có người làm @LeonidasZhak đã nhận 44 ngày trước. Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 65/100
Bioconductor/BiocParallel#286 · 1 bình luận ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 50/100
Bioconductor/BiocParallel#285 ·
-
futile.logger may be archived from CRANCó thể làm lại được @Jiefei-Wang đã nhận 282 ngày trước và không có pull request nào đang mở. Đang mở
Bioconductor/BiocParallel#284 · 2 bình luận · 1 người được giao ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
Bioconductor/BiocParallel#283 · 2 bình luận ·
-
DoparParam: Captured stdout is relayed to stdout for some foreach adapters and stderr for othersĐang mở
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
Bioconductor/BiocParallel#277 ·
Tất cả issue của Bioconductor/BiocParallel
Issue tương tự
-
Component: R
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
bug pixi-build-r
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
prefix-dev/pixi#7229 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
rstudio/reticulate#1933 ·
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 62/100