Add support functions for Mixture IS LOO
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 5/5
- Thời gian dự kiến
- Hơn một tuần
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100
Hướng nghiên cứu
Đọc vignette Mix-IS-LOO tại https://mc-stan.org/loo/articles/loo2-mixis.html và sử dụng các phép tính log_lik_mix, l_common_mix, log_weights và elpd_mixis của issue làm tham chiếu hành vi. Done cần cung cấp hỗ trợ để tạo một đối tượng loo từ mixture posterior log_lik và tính các giá trị Pareto-k khi thích hợp.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
We have the Mix-IS-LOO vignette https://mc-stan.org/loo/articles/loo2-mixis.html, but it would be useful to add support for creating a loo object from mixture posterior log_lik. Assuming the Stan model code implements the mixture distribution and generates log_lik variable, Mix-IS-LOO elpd_loo estimate is given by
log_lik_mix <- extract(fit_mix)$log_lik
l_common_mix <- rowLogSumExps(-log_lik_mix)
log_weights <- -log_lik_mix - l_common_mix
elpd_mixis <- logSumExp(-l_common_mix) - rowLogSumExps(t(log_weights))
We can also compute Pareto-k's for each pointwise elpd, but there is a difference that the mixture posterior elpd itself is already different from the regular posterior, so the error of Mix-IS-LOO tend to be smaller than regular PSIS-LOO.
- Ngôn ngữ chính
- R
- Star
- 157
- Fork
- 38
- Merge trung bình
- 4 ngày 16 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 2
Hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của stan-dev/loo
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
-
Extend loo_plot_difference Đang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100
-
Clean up issues Đang mở
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
Issue tương tự
-
Affects Web App documentation PRIORITY LOW
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 80/100
hubverse-org/hubCI#36 ·
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
-
Release 1.4.0 Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
pharmaverse/pharmaverseadam#170 ·