Add support functions for Mixture IS LOO
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- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 35/100
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Leggere la vignetta Mix-IS-LOO all’indirizzo https://mc-stan.org/loo/articles/loo2-mixis.html e usare i calcoli di log_lik_mix, l_common_mix, log_weights ed elpd_mixis dell’issue come riferimento comportamentale. Done dovrebbe fornire il supporto per creare un oggetto loo a partire da mixture posterior log_lik e calcolare i valori di Pareto-k dove applicabile.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
We have the Mix-IS-LOO vignette https://mc-stan.org/loo/articles/loo2-mixis.html, but it would be useful to add support for creating a loo object from mixture posterior log_lik. Assuming the Stan model code implements the mixture distribution and generates log_lik variable, Mix-IS-LOO elpd_loo estimate is given by
log_lik_mix <- extract(fit_mix)$log_lik
l_common_mix <- rowLogSumExps(-log_lik_mix)
log_weights <- -log_lik_mix - l_common_mix
elpd_mixis <- logSumExp(-l_common_mix) - rowLogSumExps(t(log_weights))
We can also compute Pareto-k's for each pointwise elpd, but there is a difference that the mixture posterior elpd itself is already different from the regular posterior, so the error of Mix-IS-LOO tend to be smaller than regular PSIS-LOO.
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 157
- Fork
- 38
- Merge medio
- 4g 16h
- PR unite (30g)
- 2
Guida per i contributori
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Come iniziare
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