Link to the new warnings page from `diagnose` output

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#1,096 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức phù hợp với người mới
48/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
cpp
Lĩnh vực
cli

Hướng nghiên cứu

Tìm trong mã nguồn CmdStan các chuỗi cảnh báo chẩn đoán hiện có và xác định nơi đầu ra của chúng được ghép lại. So sánh đầu ra hiện tại với đầu ra được đề xuất trong issue này, sau đó xác minh rằng hướng dẫn chi tiết được thay thế bằng URL của trang cảnh báo mà không thay đổi các kết quả chẩn đoán.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Summary:

The new warning page (https://mc-stan.org/misc/warnings.html) hopefully provides better context for understanding and diagnosing warnings from diagnose output (divergences, treedepth, ...). So the current short description and hints (e.g. increase adapt_delta or reparametrize) should be replaced with a link to the site.

Description:

Describe the issue as clearly as possible.

Current Output:
9 of 4000 (0.23%) transitions ended with a divergence.
These divergent transitions indicate that HMC is not fully able to explore the posterior distribution.
Try increasing adapt delta closer to 1.
If this doesn't remove all divergences, try to reparameterize the model.

Checking E-BFMI - sampler transitions HMC potential energy.
The E-BFMI, 0.078, is below the nominal threshold of 0.3 which suggests that HMC may have trouble exploring the target distribution.
If possible, try to reparameterize the model.

The following parameters had split R-hat greater than 1.1:
  y
Such high values indicate incomplete mixing and biased estimation.
You should consider regularizing your model with additional prior information or a more effective parameterization.
Proposed Output:
9 of 4000 (0.23%) transitions ended with a divergence.
These divergent transitions indicate that HMC is not fully able to explore the posterior distribution.

Checking E-BFMI - sampler transitions HMC potential energy.
The E-BFMI, 0.078, is below the nominal threshold of 0.3 which suggests that HMC may have trouble exploring the target distribution.

The following parameters had split R-hat greater than 1.1:
  y
Such high values indicate incomplete mixing and biased estimation.

Visit https://mc-stan.org/misc/warnings.html for a more thorough description of what the warnings mean and hints how to resolve the issues.
Current Version:

v2.29.2

Ngôn ngữ chính
C++
Star
240
Fork
105
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của stan-dev/cmdstan

Tất cả issue của stan-dev/cmdstan

Issue tương tự

Thêm issue về C++

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.