Link to the new warnings page from `diagnose` output

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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
48/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
cpp
Ambito
cli

Direzione di ricerca

Cerca nel codice sorgente di CmdStan le stringhe di avviso diagnostico esistenti e individua dove viene assemblato il loro output. Confronta l’output attuale con quello proposto in questo issue, quindi verifica che le indicazioni dettagliate siano sostituite dall’URL della pagina degli avvisi senza modificare i risultati diagnostici.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Summary:

The new warning page (https://mc-stan.org/misc/warnings.html) hopefully provides better context for understanding and diagnosing warnings from diagnose output (divergences, treedepth, ...). So the current short description and hints (e.g. increase adapt_delta or reparametrize) should be replaced with a link to the site.

Description:

Describe the issue as clearly as possible.

Current Output:
9 of 4000 (0.23%) transitions ended with a divergence.
These divergent transitions indicate that HMC is not fully able to explore the posterior distribution.
Try increasing adapt delta closer to 1.
If this doesn't remove all divergences, try to reparameterize the model.

Checking E-BFMI - sampler transitions HMC potential energy.
The E-BFMI, 0.078, is below the nominal threshold of 0.3 which suggests that HMC may have trouble exploring the target distribution.
If possible, try to reparameterize the model.

The following parameters had split R-hat greater than 1.1:
  y
Such high values indicate incomplete mixing and biased estimation.
You should consider regularizing your model with additional prior information or a more effective parameterization.
Proposed Output:
9 of 4000 (0.23%) transitions ended with a divergence.
These divergent transitions indicate that HMC is not fully able to explore the posterior distribution.

Checking E-BFMI - sampler transitions HMC potential energy.
The E-BFMI, 0.078, is below the nominal threshold of 0.3 which suggests that HMC may have trouble exploring the target distribution.

The following parameters had split R-hat greater than 1.1:
  y
Such high values indicate incomplete mixing and biased estimation.

Visit https://mc-stan.org/misc/warnings.html for a more thorough description of what the warnings mean and hints how to resolve the issues.
Current Version:

v2.29.2

Lingua principale
C++
Stelle
240
Fork
105
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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