Add human contamination removal optional step
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100
- Loại issue
- Tính năng
- Độ rõ ràng
- Cần làm rõ
- Mức độ hoạt động
- Ít trao đổi
- Lĩnh vực
- bioinformatics, data-engineering
Hướng nghiên cứu
Issue không nêu tên tệp, điểm vào, công cụ, đầu vào, đầu ra hoặc bài kiểm thử nào. Trước tiên, hãy kiểm tra cấu trúc pipeline của repository và các bước tùy chọn hiện có, sau đó làm rõ với các maintainer về cách triển khai việc loại bỏ nhiễm bẩn và các tiêu chí chấp nhận trước khi bắt đầu.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Description of feature
We have decided to have that step in the pipeline
- Ngôn ngữ chính
- Nextflow
- Star
- 22
- Fork
- 11
- Merge trung bình
- 2 ngày 5 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 10
Chuẩn bị môi trường
Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.
- Không có Dockerfile hay tệp Docker Compose
- Có mẫu pull request
- Đọc hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của nf-core/seqsubmit
-
bug
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
bug
Độ khó 3/5 Nửa ngày Mức phù hợp với người mới 70/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
Long-read end-to-end submissionCó thể đã có người làm @Vkale1 đã nhận 12 ngày trước. Đang mởenhancement
nf-core/seqsubmit#110 · 1 người được giao ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
Allow single contig genomes to be submitted as chromosomes for long-readsCó thể đã có người làm @Vkale1 đã nhận 12 ngày trước. Đang mởenhancement
nf-core/seqsubmit#109 · 1 người được giao ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
enhancement
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
Tất cả issue của nf-core/seqsubmit
Issue tương tự
-
Handle divergent markersĐang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 67/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Exclude KM192300.1 from indexĐang mởrepo:mgs-workflow
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 84/100
securebio/nao-mgs-workflow#1092 · 2 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
filter_variants declares POST, PRIOR, SPECLL and NORMLL as Number=A but writes five values per recordCó thể đã có người làm @yfarjoun đã nhận 1 ngày trước. Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
broadinstitute/permutect#304 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
bug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
nf-core/plasmodiumdrugres#119 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày