Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

Chủ sở hữu

griffithlab

Đăng nhập để theo dõi

Đã lập chỉ mục 10 kho mã nguồn · Xem trên GitHub

Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • Use FusionGDB to help identify specific fusion junction coordinates for fusions documented in CIViC
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    griffithlab/civic-editor-tools#6 ·

  • Integrate use of varaico to find variant mentions in publications
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    griffithlab/civic-editor-tools#5 ·

  • Aggregate ordering documentation gives the opposite expression rank direction
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 85/100

    griffithlab/pVACtools#1471 · 1 bình luận ·

  • Investigate possible utility of TCRbridge (AlphaBridge, Alphafold3)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/pVACtools#1470 ·

  • GKS: Store the ClinVar Entry star
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    griffithlab/civicpy#257 ·

  • Interpreting junction scores in pVACvector.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/pVACtools#1468 · 1 bình luận ·

  • Update pVACcompare list of valid columns
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug report / hotfix PR

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 58/100

    griffithlab/pVACtools#1465 ·

  • pVACseq should handle frameshift that fall "within the region of the splice site"
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    griffithlab/pVACtools#1464 ·

  • GKS: Add support for representing evidence star ratings
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#256 · 1 người được giao ·

  • Capture AI usage attestation
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/civic-v2#1498 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • Don't use special characters in tmp file names
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100

    griffithlab/pVACtools#1455 ·

  • Link shortcut to revisions opens to default page
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 64/100

    griffithlab/civic-v2#1477 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • Proposal: run CI on pull requests that target feature branches
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    dev-followup

    griffithlab/civic-v2#1473 · 1 bình luận · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • add support for ctat-lr-fusion expression
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    feature addition

    griffithlab/pVACtools#1450 · 1 người được giao ·

  • GKS: Add support for MPs with cDNA changes in the name
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100

    griffithlab/civicpy#255 · 2 bình luận ·

  • Create GKS Bundle Format for GKS JSON file
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#249 · 1 người được giao ·

  • What to do with "insufficient evidence"
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    2026 curation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/variant-curation-unconference#91 ·

  • Use of guidelines for structural variant clinical interpretation and their integration into CIViC
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    2026 curation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/variant-curation-unconference#90 ·

  • Useful Tools for Variant Curation and Improving Collaboration Between Laboratories (google form submission)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    2026 curation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 15/100

    griffithlab/variant-curation-unconference#89 ·

  • fusion protein and RNA-seq (google form submission)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    2026 curation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 15/100

    griffithlab/variant-curation-unconference#88 ·

  • Guidelines around AI use in variant interpretation (google form submission)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    2026 curation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    griffithlab/variant-curation-unconference#87 ·

  • Ways to help encourage labs to submit somatic intrpretations to ClinVar (from google form)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    2026 curation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/variant-curation-unconference#86 ·

  • The future of clinical variant interpretation: from now to 5-10 years, how it looks like (google form)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    2026 curation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/variant-curation-unconference#85 ·

  • Structural variants, CNV-calling, manual curation, OGM, NGS (from google form)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    2026 curation

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 20/100

    griffithlab/variant-curation-unconference#84 ·

  • Analysis and classification of novel fusions
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    2026 curation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/variant-curation-unconference#83 ·

  • Represent FDA Regulatory Approval, FDA Companion Test, and NCCN Guideline using GKS
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#244 · 1 người được giao ·

  • Consider MinerU as alternative to grobid for publication initial document parsing
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civic-pubtator#1 ·

  • Does pvacseq run support custom HLA/MHC sequencing input via NetMHCpan's -hlaseq option for non-model organisms?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/pVACtools#1415 ·

  • Consider new stability prediction algorithm SPEARMINT
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/pVACtools#1413 ·

  • Surface citation instructions on help docs and about/help page
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100

    griffithlab/civic-v2#1437 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • Add AA -> mRNA backtranslation to pVACvector
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/pVACtools#1411 ·

  • update `TestCivicGksPredictiveAssertion` once we have an actual approved predictive assertion that is submitted to clinvar
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/civicpy#234 ·

  • Proposal: staged behavior-preserving refactor of tool responsibility placement
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/pVACtools#1408 · 3 bình luận ·

  • Update IEDB to use Next-Generation (NG) IEDB Tools API
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/pVACtools#1400 ·

  • Update R code to tidyverse
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    griffithlab/rnabio.org#102 ·

  • Clingen API query via gene symbol fails for a few CIViC genes
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    griffithlab/civic-editor-tools#2 ·

  • Add a reference genome option to `create-vcf` in order to support GRCh38
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100

    griffithlab/civicpy#222 ·

  • adv. search results table can be pushed offscreen
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bugfix

    griffithlab/civic-v2#1403 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • Incorrect INFO field encoding in annotate-vcf output, and GRCh38 support for create-vcf
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    griffithlab/civicpy#221 · 2 bình luận ·

  • Nonsense variants not supported
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/civic-editor-tools#1 ·

  • Materialized views should not pre-filter on EID/AID status, deprecation, retraction etc
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    griffithlab/civic-v2#1399 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • Search Examples for Advanced Search
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    griffithlab/civic-v2#1398 · 7 bình luận · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • PubMed scraper improvements/bugfixes
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    griffithlab/civic-v2#1391 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • Add ability to clear filter in table views
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 58/100

    griffithlab/civic-v2#1390 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • Hide accept/reject buttons for AIDs and EIDs unless on the summary page
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 55/100

    griffithlab/civic-v2#1386 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • Allow hyperlinks/markdown/html in organization description.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 65/100

    griffithlab/civic-v2#1385 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • GKS Exporter: Add assembly information to variant
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#210 · 2 bình luận · 1 người được giao ·

  • GKS Exporter: Use Cat-VRS and VRS
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#209 · 4 bình luận ·

  • Implement automated CIViC AID submissions to ClinVar
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civic-v2#1368 · 3 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày

  • Add NMD prediction support
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/pVACtools#1370 · 1 reaction ·

Đang hiển thị 100 mục mới nhất

Trang này chỉ liệt kê những gì được lập chỉ mục gần đây. Bộ lọc nâng cao có toàn bộ kho, thu hẹp theo ngôn ngữ, độ khó và thời lượng.

Mở bộ lọc nâng cao

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.