griffithlab/civicpy

Đăng nhập để theo dõi Xem trên GitHub

A python interface for the CIViC db application

griffithlab/civicpy có thân thiện với người mới không?

Gần đây có quá ít pull request của người đóng góp bên ngoài gửi tới griffithlab/civicpy để nói chúng được merge thường xuyên đến đâu. Hiện chưa có issue nào phù hợp với người mới đang mở; danh sách bên dưới là các issue khác chúng tôi có của kho này.

Star
13
Fork
8
Issue cho người mới đang mở
0
Issue đã lập chỉ mục
32
Ngôn ngữ chính
Python
Giấy phép
MIT
Lần push lên GitHub gần nhất
17/7/2026
Lập chỉ mục gần nhất
20/9/2026
Không có hướng dẫn đóng góp
Không có quy tắc ứng xử
Label cho người mới
Chưa lập chỉ mục label nào cho người mới
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Cách đóng góp cho griffithlab/civicpy

  1. Dự án không có hướng dẫn đóng góp, vì vậy hãy bắt đầu từ README và vài pull request vừa được merge để xem thay đổi được đề xuất thế nào.
  2. Dự án có Dockerfile hoặc tệp Docker Compose, nên bạn có thể chạy nó mà không cần cài cả bộ công cụ.
  3. Đóng góp của bạn sẽ được phát hành theo giấy phép MIT của dự án.
  4. Theo dõi kho này để biết khi có issue mới phù hợp với người mới, hoặc xem các issue khác bên dưới.
Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • GKS: Store the ClinVar Entry star
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    griffithlab/civicpy#257 ·

  • GKS: Add support for representing evidence star ratings
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#256 · 1 người được giao ·

  • GKS: Add support for MPs with cDNA changes in the name
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100

    griffithlab/civicpy#255 · 2 bình luận ·

  • Create GKS Bundle Format for GKS JSON file
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#249 · 1 người được giao ·

  • Represent FDA Regulatory Approval, FDA Companion Test, and NCCN Guideline using GKS
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#244 · 1 người được giao ·

  • update `TestCivicGksPredictiveAssertion` once we have an actual approved predictive assertion that is submitted to clinvar
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/civicpy#234 ·

  • Add a reference genome option to `create-vcf` in order to support GRCh38
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100

    griffithlab/civicpy#222 ·

  • Incorrect INFO field encoding in annotate-vcf output, and GRCh38 support for create-vcf
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    griffithlab/civicpy#221 · 2 bình luận ·

  • GKS Exporter: Add assembly information to variant
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#210 · 2 bình luận · 1 người được giao ·

  • GKS Exporter: Use Cat-VRS and VRS
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#209 · 4 bình luận ·

  • Handle GeneVariants with GRCh38 coordinates in the VCF creation step
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 32/100

    griffithlab/civicpy#195 ·

  • Endorse different assertion in staging
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    griffithlab/civicpy#194 ·

  • CIViC GKS Export should not support complex molecular profiles
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#191 · 1 người được giao ·

  • CIViC GKS Exporter should support complex molecular profiles
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#185 · 2 bình luận · 1 người được giao ·

  • GRCh38 query - offline environment
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#182 · 2 bình luận · 2 reaction ·

  • Add heartbeat API tests
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    griffithlab/civicpy#163 ·

  • Add GKS transformer support for FusionVariants
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    griffithlab/civicpy#162 ·

  • Pull back is_flagged boolean for entities that can be flagged
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#159 ·

  • therapy names aren't unique per Evidence, and Disease property field sometimes is not there
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/civicpy#153 · 2 bình luận ·

  • Handle stale remote caches
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/civicpy#142 ·

  • is there any useful examples of how to use it
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#119 ·

  • activity caching and search
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#101 ·

  • speed up tests
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#93 · 1 bình luận ·

  • No remote queries option
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    griffithlab/civicpy#74 · 1 bình luận ·

  • add support for revisions and projections
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#50 · 1 bình luận ·

  • refactor object retrieval from cache
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    griffithlab/civicpy#48 · 1 người được giao ·

  • validate coordinates
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    griffithlab/civicpy#15 ·

  • add CIViCpy to ProgrammableWeb directory
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 30/100

    griffithlab/civicpy#8 ·

  • Support GRCH37 to 38 conversion
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#4 · 2 bình luận ·

  • add contributions by user summarizations
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    griffithlab/civicpy#1 ·

  • GKS: Extension names should use camel case naming convention
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?

    griffithlab/civicpy#243 · 1 người được giao ·

  • GKS Exporter: Support Oncogenicity Assertions
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    griffithlab/civicpy#217 · 1 bình luận · 1 người được giao ·

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.