Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

possble DelayedArray constructor over `IntegerList` (or other `List`)

Đang mở
#27 3 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
5/5
Thời gian dự kiến
Hơn một tuần
Mức phù hợp với người mới
25/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
r
Lĩnh vực
data

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu từ constructor của DelayedArray và tái hiện ví dụ IntegerList trong issue, so sánh với DelayedArray(array(XX)). Xác định phạm vi cần thiết để hỗ trợ trực tiếp List và xác minh rằng thao tác slicing trả về một IntegerList thay vì một list thông thường.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

enhancement

Hi @hpages ,

In the VariantAnnotation package, the CollapsedVCF (or ExpandedVCF) are saving the data entries in IntegerList / CharacterList.... And in the development of VCFArray, we are trying to represent these data entries as DelayedArray instances. Now we are converting the data entries into array to add dimension, and then use the DelayedArray constructor over the array. Is it possible to have the DelayedArray constructor directly work on List object? so that the internal data saving are still using a more efficient way in List structure than the ordinary list? @mtmorgan

 > XX <- IntegerList(c(list(rep(NA, 2)), list(rep(NA, 2)), list(rep(NA, 2)), list(rep(NA, 2))))
 > XX
 IntegerList of length 4
 [[1]] <NA> <NA>
 [[2]] <NA> <NA>
 [[3]] <NA> <NA>
 [[4]] <NA> <NA>

 > DelayedArray(array(XX))
 <4> DelayedArray object of type "list":          ## the type is ordinary list. 
    [1]    [2]    [3]    [4]
 NA, NA NA, NA NA, NA NA, NA

!> DelayedArray(array(XX))[1:2]  
 [[1]]
 [1] NA NA

 [[2]]
 [1] NA NA

## What we want is something like: 

!> DelayedArray(XX)
 <4> DelayedArray object of type "IntegerList":      
    [1]    [2]    [3]    [4]
 NA, NA NA, NA NA, NA NA, NA

!> DelayedArray(XX)[1:2]  
 IntegerList of length 2
 [[1]] <NA> <NA>
 [[2]] <NA> <NA>
Ngôn ngữ chính
R
Star
29
Fork
12
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của Bioconductor/DelayedArray

Tất cả issue của Bioconductor/DelayedArray

Issue tương tự

Thêm issue về R

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.