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[User story proposal] Describe Xarray for protein ML/AI work

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Avaliação

Dificuldade
3/5
Tempo estimado
1-2 dias
Facilidade para iniciantes
35/100
Tipo de issue
Documentação
Clareza
Claramente especificada
Status de atividade
Estagnada
Stack de tecnologia
markdown, pytorch
Domínio
content, documentation, machine-learning

Direção de pesquisa

Review the existing Markdown posts in xarray.dev's src/posts and their front matter, then use the proposed outline to gather or draft a short protein-engineering user story. Done means the story is ready for publication on the Xarray blog, with any useful images, code blocks, links, and references included.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Descrição

user-story

This is a proposal for a sequencing/protein engineering use case story for Xarray. The story will be published on Xarray's blog (https://xarray.dev/blog).

Why?

@asford and colleagues are quite excited about using Xarray +torch for generative ML models and "protein engineering". It'd be nice to broadcast this out.

It's also interesting that they find coordinate variables quite useful and so DataArray is the right structure rather than Variable/NamedArray/pytorch.NamedTensor

What?

We are targeting a short and non-technical post that illustrates how Xarray is (or could be) used in your genomics context. Below is a template outline that you should feel free to modify:

  1. Who am I?
  2. What problem am I trying to solve?
  3. How does Xarray help?
  4. Why did I choose Xarray?
  5. Current pain points (or ways that Xarray could better serve your use case)
  6. Technology I use around Xarray
  7. Anything else to know?
  8. Links and references

Feel free to insert images or short code blocks if they help you tell your story.

How?

Xarray's blog using Markdown with some front-matter. You can copy one of the existing posts to get started or you can write in a google-doc-like-thing and ask us to do the markdown formatting. If you copy a previous post, use a name like user-story-genomics or whatever makes sense for your application.

xref: https://github.com/xarray-contrib/xarray.dev/issues/272

Linguagem predominante
JavaScript
Estrelas
14
Forks
31
Merge médio
5h 26min
PRs com merge (30d)
1

Preparar o ambiente

Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

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