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[User story proposal] Describe Xarray for protein ML/AI work

Offen
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Bewertung

Schwierigkeit
3/5
Geschätzter Aufwand
1-2 Tage
Anfängerfreundlichkeit
35/100
Issue-Typ
Dokumentation
Klarheit
Klar beschrieben
Aktivitätsstatus
Veraltet
Tech-Stack
markdown, pytorch
Bereich
content, documentation, machine-learning

Rechercherichtung

Review the existing Markdown posts in xarray.dev's src/posts and their front matter, then use the proposed outline to gather or draft a short protein-engineering user story. Done means the story is ready for publication on the Xarray blog, with any useful images, code blocks, links, and references included.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

user-story

This is a proposal for a sequencing/protein engineering use case story for Xarray. The story will be published on Xarray's blog (https://xarray.dev/blog).

Why?

@asford and colleagues are quite excited about using Xarray +torch for generative ML models and "protein engineering". It'd be nice to broadcast this out.

It's also interesting that they find coordinate variables quite useful and so DataArray is the right structure rather than Variable/NamedArray/pytorch.NamedTensor

What?

We are targeting a short and non-technical post that illustrates how Xarray is (or could be) used in your genomics context. Below is a template outline that you should feel free to modify:

  1. Who am I?
  2. What problem am I trying to solve?
  3. How does Xarray help?
  4. Why did I choose Xarray?
  5. Current pain points (or ways that Xarray could better serve your use case)
  6. Technology I use around Xarray
  7. Anything else to know?
  8. Links and references

Feel free to insert images or short code blocks if they help you tell your story.

How?

Xarray's blog using Markdown with some front-matter. You can copy one of the existing posts to get started or you can write in a google-doc-like-thing and ask us to do the markdown formatting. If you copy a previous post, use a name like user-story-genomics or whatever makes sense for your application.

xref: https://github.com/xarray-contrib/xarray.dev/issues/272

Vorherrschende Sprache
JavaScript
Sterne
14
Forks
30
Ø Merge
5 Std. 26 Min.
Gemergte PRs (30 T.)
1

Entwicklungsumgebung

Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.

Erste Schritte

  1. Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
  4. Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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