Lineplot's geometric mean throwing 500s with y-axis date vars
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Avaliação
- Dificuldade
- 3/5
- Tempo estimado
- 1-2 dias
- Facilidade para iniciantes
- 42/100
- Tipo de issue
- Bug
- Clareza
- Razoavelmente clara
- Status de atividade
- Estagnada
- Stack de tecnologia
- r
- Domínio
- data-visualization
Direção de pesquisa
Start by reproducing the lineplot geometric mean request with a Date-valued y-axis using the Amazonia ICEMR Brazil Cohort, then follow the Rserve error where Math.Date receives a Date object. Compare it with the successful geometric mean response; done means the Date-axis request no longer returns a 500.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
In implementing the new lineplot UI to include Geometric Mean, I encounter a 500 error when the y-axis variable is a Date object. I've included a screenshot showing the request and lineplot config using Amazonia ICEMR Brazil Cohort and the subsequent error log. At the end, I've included a successful response for a lineplot geometric mean request.
Screenshot of Error Config
Error Log
==> /var/log/containers/docker.eda_dev_rserve_1.log <==
Rserve started in non-daemon mode.
2022-08-23 21:01:34 Map has been validated.
2022-08-23 21:01:34 Encountered empty or NULL naToZero value. Setting naToZero = FALSE.
2022-08-23 21:01:34 Encountered empty or NULL naToZero value. Setting naToZero = FALSE.
2022-08-23 21:01:34 Determined the number of complete cases per variable.
2022-08-23 21:01:34 Identified facet intersections.
2022-08-23 21:01:34 Base data types updated for all columns as necessary.
2022-08-23 21:01:34 Determined total number of complete cases across axes and strata vars.
2022-08-23 21:01:34 Calculated sample sizes per group.
2022-08-23 21:01:34 Base plot.data object created.
2022-08-23 21:01:34 Determined default viewport.
2022-08-23 21:01:34 Determined bin width slider min, max and step values.
Error in Math.Date(x[x > 0]) : log not defined for "Date" objects
==> /var/log/containers/docker.eda_dev_user_1.log <==
Screenshot of Successful Response
- Linguagem predominante
- R
- Estrelas
- 1
- Forks
- 0
- Métricas de merge de PRs
- Nenhum PR com merge em 30d
Preparar o ambiente
Inicia o contêiner de desenvolvimento do projeto no navegador, com a sua própria conta do GitHub.
- Sem Dockerfile nem arquivo Docker Compose
- Sem modelo de pull request
- Sem guia de contribuição
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
Mais de VEuPathDB/plot.data
-
Need to look into exports of `toJSON`Talvez já em andamento Um pull request vinculado a esta issue está aberto ou já foi mesclado. Aberta
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 25/100
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Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100
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empty two by twoAberta
Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100
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