Lineplot's geometric mean throwing 500s with y-axis date vars
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Évaluation
- Difficulté
- 3/5
- Temps estimé
- 1-2 jours
- Accessibilité débutants
- 42/100
- Type d'issue
- Bug
- Clarté
- Plutôt claire
- Activité
- À l'abandon
- Stack technique
- r
- Domaine
- data-visualization
Piste de recherche
Start by reproducing the lineplot geometric mean request with a Date-valued y-axis using the Amazonia ICEMR Brazil Cohort, then follow the Rserve error where Math.Date receives a Date object. Compare it with the successful geometric mean response; done means the Date-axis request no longer returns a 500.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
In implementing the new lineplot UI to include Geometric Mean, I encounter a 500 error when the y-axis variable is a Date object. I've included a screenshot showing the request and lineplot config using Amazonia ICEMR Brazil Cohort and the subsequent error log. At the end, I've included a successful response for a lineplot geometric mean request.
Screenshot of Error Config
Error Log
==> /var/log/containers/docker.eda_dev_rserve_1.log <==
Rserve started in non-daemon mode.
2022-08-23 21:01:34 Map has been validated.
2022-08-23 21:01:34 Encountered empty or NULL naToZero value. Setting naToZero = FALSE.
2022-08-23 21:01:34 Encountered empty or NULL naToZero value. Setting naToZero = FALSE.
2022-08-23 21:01:34 Determined the number of complete cases per variable.
2022-08-23 21:01:34 Identified facet intersections.
2022-08-23 21:01:34 Base data types updated for all columns as necessary.
2022-08-23 21:01:34 Determined total number of complete cases across axes and strata vars.
2022-08-23 21:01:34 Calculated sample sizes per group.
2022-08-23 21:01:34 Base plot.data object created.
2022-08-23 21:01:34 Determined default viewport.
2022-08-23 21:01:34 Determined bin width slider min, max and step values.
Error in Math.Date(x[x > 0]) : log not defined for "Date" objects
==> /var/log/containers/docker.eda_dev_user_1.log <==
Screenshot of Successful Response
- Langage dominant
- R
- Étoiles
- 1
- Forks
- 0
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Préparer son environnement
Lance le conteneur de développement du projet dans votre navigateur, avec votre propre compte GitHub.
- Aucun Dockerfile ni fichier Docker Compose
- Aucun modèle de pull request
- Aucun guide de contribution
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
- Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
Autres issues de VEuPathDB/plot.data
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Need to look into exports of `toJSON`Peut-être pris Une pull request liée à cette issue est ouverte ou déjà fusionnée. Ouverte
Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 25/100
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Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
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Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100
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Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100
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empty two by twoOuverte
Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100
Toutes les issues de VEuPathDB/plot.data
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