Teaching-lab set-ups run through in ECCE: Gaussian 16 scan, QST3, IRC, thermochemistry and Raman; GROMACS umbrella sampling with WHAM; QSAR
Ninguém assumiu esta issue ainda.
Avaliação
- Dificuldade
- 5/5
- Tempo estimado
- Mais de uma semana
- Facilidade para iniciantes
- 25/100
- Tipo de issue
- Funcionalidade
- Clareza
- Precisa de esclarecimento
- Status de atividade
- Ativa
- Stack de tecnologia
- c
- Domínio
- desktop-dev
Direção de pesquisa
Read issue #564 first, then review ECCE’s existing Gaussian 16 and GROMACS workflow entry points to identify what is already supported. The issue is an umbrella list and does not name files, tests, or concrete gaps. A related issue should define one workflow’s setup, launch, analysis, and expected outputs before implementation.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
Lab exercises that today are prepared outside ECCE, to be set up, launched and analysed entirely in ECCE, with what is missing filed as issues:
- Gaussian 16: relaxed scan, QST3 transition state, IRC, thermochemistry, Raman.
- GROMACS: umbrella sampling, windows taken from a pull trajectory, analysis with WHAM (gmx wham) and the PMF plotted.
- QSAR: descriptors from a set of calculations, a regression against measured values.
Related: the spring QM lab run-through (#564).
- Linguagem predominante
- C
- Estrelas
- 10
- Forks
- 8
- Merge médio
- 21min
- PRs com merge (30d)
- 1
Preparar o ambiente
Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
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