Teaching-lab set-ups run through in ECCE: Gaussian 16 scan, QST3, IRC, thermochemistry and Raman; GROMACS umbrella sampling with WHAM; QSAR
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Evaluación
- Dificultad
- 5/5
- Tiempo estimado
- Más de una semana
- Aptitud para principiantes
- 25/100
- Tipo de issue
- Nueva funcionalidad
- Claridad
- Necesita aclaración
- Estado de actividad
- Activo
- Stack tecnológico
- c
- Área
- desktop-dev
Línea de trabajo
Read issue #564 first, then review ECCE’s existing Gaussian 16 and GROMACS workflow entry points to identify what is already supported. The issue is an umbrella list and does not name files, tests, or concrete gaps. A related issue should define one workflow’s setup, launch, analysis, and expected outputs before implementation.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Lab exercises that today are prepared outside ECCE, to be set up, launched and analysed entirely in ECCE, with what is missing filed as issues:
- Gaussian 16: relaxed scan, QST3 transition state, IRC, thermochemistry, Raman.
- GROMACS: umbrella sampling, windows taken from a pull trajectory, analysis with WHAM (gmx wham) and the PMF plotted.
- QSAR: descriptors from a set of calculations, a regression against measured values.
Related: the spring QM lab run-through (#564).
- Lenguaje dominante
- C
- Estrellas
- 10
- Forks
- 8
- Merge medio
- 21 min
- PR fusionados (30 d)
- 1
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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