Aerophilicity: four Bergey's genera annotated both aerobic and anaerobic, always

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評価

難易度
3/5
見積もり時間
1〜2日
初心者へのやさしさ
57/100
issue の種類
バグ
明瞭さ
おおむね明確
活発さ
活発
技術スタック
r
領域
data

調査の方向性

Read the four genus entries in the linked spreadsheet and compare them with the corresponding Bergey's Manual text, starting with the Oceanobacillus and Streptobacillus clues in the issue. Determine whether each genus is aerobic, anaerobic, or facultatively anaerobic, then update the affected annotations and verify the pipeline no longer produces a 0.5/0.5 split for them. The issue does not name the repository files or tests to use.

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

curation

Four genus rows from the Bergey's Manual scrape carry aerobic and anaerobic both with Frequency always, which the pipeline turns into a 0.5/0.5 split. Bergey's text will say which it is; most likely facultatively anaerobic, or one of the two.

Sheet: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1JgUzttAZf5Qu2obZ_2xXqsnEr_I1XKn_ZzNvrE6ssO4

  • Halostella
  • Oceanobacillus (most species are facultatively anaerobic)
  • Salinisphaera
  • Streptobacillus (facultatively anaerobic)

Related: #259 (Bacillus). Eleven more genera have aerobic + facultatively anaerobic splits from the same source; those are defensible and can stay.

Drafted with Claude Code.

主要言語
R
スター
6
フォーク
6
平均マージ
1時間 48分
マージ済み PR(30日)
13

環境構築

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

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