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tseemann のリポジトリ

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tseemann/homebrew-extraRuby

:candy::penguin: Linux-only formulae that are not dependencies of core formulae

最終コミット 2018/03/24

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/homebrew-scienceRuby

:snowflake: Scientific formulae for Homebrew and Linuxbrew (legacy)

最終コミット 2019/04/12

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/injectaPerl

Insert genes into genomes to aid synthetic test data generation

最終コミット 2019/09/05

 (5 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/iupakPerl

Decode and display IUPAC code information

最終コミット 2026/01/03

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/joystx

Shigatoxin STX typing for E.coli STEC

最終コミット 2019/02/07

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/k2dbHTML

Kraken 2 database management tool

最終コミット 2026/01/07

 (2 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/kalignC

A fast multiple sequence alignment program.

最終コミット 2019/10/28

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/kloshamC

Find closest aligned sequences to a query sequnece

最終コミット 2022/04/03

 (6 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/kopynumba

Identify copy number variation in bacterial Illumina sequences

最終コミット 2020/08/13

 (6 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/kountaPerl

🧮 🔢 Generate multi-sample k-mer count matrix from WGS

最終コミット 2026/01/17

 (11 stars) (3 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/kroucha

Mock repository for Sanger publications citing Croucher et al

最終コミット 2018/10/27

 (1 star) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/kurra

Fast whole genome phylogeny

最終コミット 2020/12/08

 (4 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/lathePython

A tool for generating bacterial genomes from metagenomes with nanopore long read sequencing

最終コミット 2019/10/14

 (1 star) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/legstaPerl

🍗⭐ In silico Legionella pneumophila Sequence Based Typing

最終コミット 2026/02/08

 (11 stars) (5 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/linuxbrew-coreRuby

🍻🐧 Core formulae for the Homebrew package manager on Linux

最終コミット 2020/02/25

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/mini-outbreak

Small WGS dataset for testing bacterial outbreak analysis pipelines

最終コミット 2019/08/23

 (2 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/minimap2C

A versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences

最終コミット 2019/07/18

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/mlstPerl

:id: Scan contig files against PubMLST typing schemes

最終コミット 2026/03/26

 (285 stars) (58 forks) (2 件の索引済み issue) (2 件のオープンな good first issue)
tseemann/mlst-1Roff

Singularity container for MLST

最終コミット 2018/02/09

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
tseemann/mlstk

Next generation MLST toolkit

最終コミット 2025/12/09

 (5 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)