tseemann のリポジトリ

Summary of the torstyverse bioinformatics softwate suite

最終コミット 2026/02/08

最終コミット 2013/10/31

ClonalFrameML: Efficient Inference of Recombination in Whole Bacterial Genomes

最終コミット 2019/08/27

Interactive, web tool for exploring pan-genome of bacterial strains

最終コミット 2017/03/21

最終コミット 2019/10/07

MUMmer3

最終コミット 2013/04/30

MapCaller – An efficient and versatile approach for short-read alignment and variant detection in high-throughput sequenced genomes

最終コミット 2020/02/16

Fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

最終コミット 2019/10/18

Pair-End AssembeR

最終コミット 2014/04/16

An ultra fast and accurate paired-end adapter trimmer that needs no a priori adapter sequences.

最終コミット 2015/03/04

A toolbox for pangenome analysis and threshold evaluation.

最終コミット 2019/09/30

Prodigal Gene Prediction Software

最終コミット 2015/02/18

Rapid large-scale prokaryote pan genome analysis

最終コミット 2019/11/01

Salmonella serotyping from genome sequencing data

最終コミット 2018/09/03

最終コミット 2019/05/27

Profiling tool for Mycobacterium tuberculosis to detect ressistance and strain type from WGS data

最終コミット 2020/03/05

The Other Alternative Sequence Type

最終コミット 2026/02/27

最終コミット 2018/10/10

hybrid assembly pipeline for bacterial genomes

最終コミット 2019/10/21

:chart_with_upwards_trend: Automatically optimise three of Velvet's assembly parameters.

最終コミット 2017/12/21