tseemann のリポジトリ

Summary of the torstyverse bioinformatics softwate suite

最終コミット 2026年2月8日

最終コミット 2013年10月31日

ClonalFrameML: Efficient Inference of Recombination in Whole Bacterial Genomes

最終コミット 2019年8月27日

Interactive, web tool for exploring pan-genome of bacterial strains

最終コミット 2017年3月21日

最終コミット 2019年10月7日

MUMmer3

最終コミット 2013年4月30日

MapCaller – An efficient and versatile approach for short-read alignment and variant detection in high-throughput sequenced genomes

最終コミット 2020年2月16日

Fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

最終コミット 2019年10月18日

Pair-End AssembeR

最終コミット 2014年4月16日

An ultra fast and accurate paired-end adapter trimmer that needs no a priori adapter sequences.

最終コミット 2015年3月4日

A toolbox for pangenome analysis and threshold evaluation.

最終コミット 2019年9月30日

Prodigal Gene Prediction Software

最終コミット 2015年2月18日

Rapid large-scale prokaryote pan genome analysis

最終コミット 2019年11月1日

Salmonella serotyping from genome sequencing data

最終コミット 2018年9月3日

最終コミット 2019年5月27日

Profiling tool for Mycobacterium tuberculosis to detect ressistance and strain type from WGS data

最終コミット 2020年3月5日

The Other Alternative Sequence Type

最終コミット 2026年2月27日

最終コミット 2018年10月10日

hybrid assembly pipeline for bacterial genomes

最終コミット 2019年10月21日

:chart_with_upwards_trend: Automatically optimise three of Velvet's assembly parameters.

最終コミット 2017年12月21日