sunlabuiuc/PyHealth

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• clean_path() normalises URL paths with os.path.normpath, breaking every URL-rooted dataset on Windows

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 77/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1333 · コメント 1 件 · 2026年10月26日 に作成

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• Add Survival Mixture Density Networks for survival prediction

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1297 · 2026年10月15日 に作成

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• Interrupted first build leaves a partial event table which later runs use without a warning

  オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 22/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1295 · コメント 1 件 · 2026年10月14日 に作成

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• OMOP: add observation_period and visit_detail to the default config

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 42/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1294 · コメント 1 件 · 2026年10月14日 に作成

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• FHIR Bug Issues Thread

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1157 · コメント 1 件 · 2026年6月7日 に作成

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• Generative modeling module bug forum thread

  オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1156 · コメント 1 件 · 2026年6月7日 に作成

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• Reproducibility gap in ICU pathogen prediction benchmarks (MIMIC-IV)

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1153 · コメント 1 件 · 2026年5月29日 に作成

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• [Feature] Implement KeyClass (Weak Supervision) for Clinical Notes

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1107 · 2026年4月22日 に作成

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• Interpretability Target_Idx / Multilabel setting is not well-defined

  オープン

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  documentation

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#915 · コメント 1 件 · 2026年3月27日 に作成

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• PyHealth trainer uses deprecated model.mode attribute instead of checking its output or label processors

  再び着手できるかも このイシューのプルリクエストはマージされずにクローズされました。 オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#914 · コメント 1 件 · 2026年3月27日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• Add SepsisPredictionEICU and SepsisPredictionMIMIC4 tasks — pre-ICU window, Sepsis-3 proxy labeling

  再び着手できるかも @zhaog100 が 217 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#911 · コメント 3 件 · 2026年3月25日 に作成

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• Add documentation to each dataset on download sources, and what files specifically are compatible.

  再び着手できるかも @sevvaluluss が 209 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#883 · コメント 3 件 · 2026年3月6日 に作成

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• PyHealth processors -> embeddings not clear which are compatible

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#865 · 2026年2月20日 に作成

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• A few interpreters (e.g. SHAP & LIME, maybe more) incorrectly always assume input is sequence or time series

  再び着手できるかも @sakshigupta1528 が 8 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

  sunlabuiuc/PyHealth#858 · コメント 3 件 · 2026年2月17日 に作成

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• Investigate whether short circuit if statements speed up task sample processing

  再び着手できるかも @yugdave0911 が 198 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#843 · コメント 4 件 · 2026年2月12日 に作成

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• Dataset cache name doesn't seem to include the tables used when cache_dir is set.

  オープン

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  bug

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

  sunlabuiuc/PyHealth#833 · 2026年2月9日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• masking has been proven to be problematic even for now. especially some methods will zero values for perturbation, which cause the x.sum(dim=...) == 0 method fail significantly.

  オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

  sunlabuiuc/PyHealth#820 · 2026年2月5日 に作成

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• Interpretability bugs and improvements required

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 28/100

  sunlabuiuc/PyHealth#817 · 2026年2月5日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• Add a `.clear_cache` and `.clear_task_cache` method to avoid the need to manually delete the cache.

  再び着手できるかも @Eshaan-byte が 299 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  sunlabuiuc/PyHealth#765 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 · 2026年1月1日 に作成

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• Better docs for the cache behaviour.

  再び着手できるかも @JairoTM-es が 299 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  sunlabuiuc/PyHealth#763 · コメント 9 件 · 担当者 1 名 · 2026年1月1日 に作成

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• [Tracking] Tracking issue for the new memory efficient dataset.

  再び着手できるかも @Logiquo が 313 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  sunlabuiuc/PyHealth#740 · コメント 3 件 · 担当者 1 名 · 2025年12月17日 に作成

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• Integrate senselab for speech analysis in health

  再び着手できるかも @Chelsy-AI が 141 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  enhancement

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#566 · コメント 3 件 · 2025年9月26日 に作成

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• parser for table NOTEEVENTS is not implemented yet.

  再び着手できるかも このイシューのプルリクエストはマージされずにクローズされました。 オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

  sunlabuiuc/PyHealth#512 · コメント 1 件 · 2025年5月13日 に作成

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• Update model API to better fit new dataloading framework.

  オープン

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  bug

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#426 · 2025年5月6日 に作成

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• Unit Tests

  再び着手できるかも このイシューのプルリクエストはマージされずにクローズされました。 オープン

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  help wanted

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#425 · 2025年5月6日 に作成

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• Fix the datetime in synthetic mimic-iii data

  オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 45/100

  sunlabuiuc/PyHealth#373 · コメント 1 件 · 2025年5月1日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• Fix sample dataset indexing

  再び着手できるかも @ram-from-tvl が 392 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  sunlabuiuc/PyHealth#369 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 · 2025年4月30日 に作成

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• EEG Datasets Need to Conform with 2.0 Backend

  オープン

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  core

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#340 · 2025年4月18日 に作成

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• Improve unittests and Github actions

  再び着手できるかも このイシューのプルリクエストはマージされずにクローズされました。 オープン

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  infra

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#338 · 2025年4月16日 に作成

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• Integration with MEDS

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#329 · 2025年4月9日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• Expand MIMIC-III configs

  再び着手できるかも @jhnwu3 が 566 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  enhancement

  sunlabuiuc/PyHealth#328 · 担当者 1 名 · 2025年4月9日 に作成

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• Expand MIMIC-IV configs

  再び着手できるかも @jhnwu3 が 566 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  enhancement

  sunlabuiuc/PyHealth#327 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2025年4月9日 に作成

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• Update signal API

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#325 · 2025年4月9日 に作成

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• Update document to reflect the changes in v2.0

  オープン

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#324 · コメント 3 件 · 2025年4月9日 に作成

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• HALO and EHR synthetic task

  オープン

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  sunlabuiuc/PyHealth#279 · コメント 2 件 · 2024年4月15日 に作成

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• Internal transfers are counted as readmissions

  対応中かも @thebean27 が 21 日前に担当しました。 オープン

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  sunlabuiuc/PyHealth#1269 · コメント 3 件 · 2026年10月5日 に作成

  メンテナーはふだん 3 日以内に返信

• PyHealth 2.0: several modules still target the 1.x dataset API

  対応中かも このイシューにリンクされたプルリクエストがオープン中、またはマージ済みです。 オープン

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  sunlabuiuc/PyHealth#1201 · コメント 3 件 · 2026年8月25日 に作成

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• Refactor: split CheferInterpretable into AttentionInterpretable and GradientInterpretable

  対応中かも @LIU-kaiyu が 51 日前に担当しました。 オープン

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  enhancement refactor

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1166 · 2026年6月21日 に作成

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• fix: add missing stacklevel=2 to warnings.warn() calls

  対応中かも @rtmalikian が 129 日前に担当しました。 オープン

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  sunlabuiuc/PyHealth#1164 · 2026年6月20日 に作成

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• fix: kg_emb broken import in PyHealth 2.0

  対応中かも @userjuma が 69 日前に担当しました。 オープン

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  sunlabuiuc/PyHealth#952 · コメント 3 件 · 2026年4月7日 に作成

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• Task hash should probably also include the init args of a TaskClass()

  対応中かも @7arnav1 が 97 日前に担当しました。 オープン

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  documentation

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 52/100

  sunlabuiuc/PyHealth#916 · コメント 2 件 · 2026年3月27日 に作成

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• Create file structure standard/documentation for how people should port over their task data splits.

  対応中かも @Aprameyaraya が 14 日前に担当しました。 オープン

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  documentation

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  sunlabuiuc/PyHealth#913 · 2026年3月27日 に作成

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• trainer.evaluate of metrics is inconsistent due to batch-wise aggregation

  対応中かも @azrabano23 が 65 日前に担当しました。 オープン

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  bug

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#859 · コメント 4 件 · 2026年2月17日 に作成

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• Add normalization support in `pyhealth/processors/timeseries_processor.py`

  対応中かも @LIU-kaiyu が 51 日前に担当しました。 オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#491 · 2025年5月8日 に作成

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