Convention for output of tuples
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評価
- 難易度
- 5/5
- 見積もり時間
- 1週間以上
- 初心者へのやさしさ
- 35/100
調査の方向性
Start with the tuple_out.stan example and the test_tuple_out test shown in the issue, then inspect fit.stan_variable("c") and fit.c behavior. Compare array-of-tuples and tuple-of-arrays layouts, and define the resulting sample indexing convention before updating the relevant tests and documentation.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
In the develop branch, tuples generated by Stan programs are one-dimensional arrays of tuples. This can make it difficult to access elements of tuples. For example, consider the following test.
def test_tuple_out() -> None:
stan = os.path.join(DATAFILES_PATH, 'tuple_out.stan')
model = CmdStanModel(stan_file=stan)
a = np.random.normal(0, 1, (5, 5))
b = np.random.normal(0, 1, 3)
fit = model.sample({"a": a, "b": b}, fixed_param=True, chains=1,
iter_sampling=20, iter_warmup=1, sig_figs=18)
np.testing.assert_allclose(a, fit.stan_variable("c")[0][0])
np.testing.assert_allclose(b, fit.stan_variable("c")[0][1])
// tuple_out.stan
data {
matrix [5, 5] a;
vector [3] b;
}
generated quantities {
tuple(matrix[5, 5], vector[3]) c;
c.1 = a;
c.2 = b;
}
Then accessing c.1 samples is only possible through list comprehension (there may be some fancy indexing I'm not familiar with).
>>> fit.c.shape
(20,)
>>> fit.c[:, 0]
IndexError: too many indices for array: array is 1-dimensional, but 2 were indexed
Would it make sense to return a tuple of arrays rather than an array of tuples? This would allow accessing samples more easily, e.g., in the above example we'd get
>>> fit.c[0].shape
(20, 5, 5)
This would however go against the convention that the first index refers to samples.
- 主要言語
- Python
- スター
- 198
- フォーク
- 82
- 平均マージ
- 4日 11時間
- マージ済み PR（30日）
- 3
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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