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nf-core/sarek

Analysis pipeline to detect germline or somatic variants (pre-processing, variant calling and annotation) from WGS / targeted sequencing

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最終索引
2026/08/13
最終 GitHub push
2026/07/30
ライセンス
MIT License
コントリビューションガイド
コントリビューションガイド
行動規範
行動規範
主要言語
Nextflow
PR merge metrics
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初心者向けラベル
help wantedgood first issue

Issue

6 件のオープンな索引 Issue

オープン
Enable Mutect2 force-calling using --alleles flag
enhancementgood first issue
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nf-core / sarek · #1883 · 2025/05/02 · Nextflow · 589 個のスター

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Tutorial: CNV calling
enhancementhelp wanted
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nf-core / sarek · #1713 · 2024/10/30 · Nextflow · 589 個のスター

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Proposals for Sarek Tutorials on use-cases
docshelp wantedtesting
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nf-core / sarek · #1704 · 2024/10/28 · Nextflow · 589 個のスター

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Get a full nf-test report in cis
enhancementhelp wanted
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nf-core / sarek · #1699 · 2024/10/28 · Nextflow · 589 個のスター

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オープン
No status is 0 - but contains tumor only sample error message
bughelp wanted
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nf-core / sarek · #1685 · 2024/10/11 · Nextflow · 589 個のスター

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オープン
joint genotyping optimal strategy
help wanted
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nf-core / sarek · #923 · 2023/01/25 · Nextflow · 589 個のスター

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