nf-core/sarek

Tutorial: CNV calling

オープン

#1,713 opened on 2024/10/30

GitHub で見るコントリビューターガイド
 (0 件のコメント) (0 件のリアクション) (0 人の担当者)Nextflow (539 件のフォーク)auto 404
enhancementhelp wanted

Repository metrics

Stars
 (589 個のスター)
PR merge metrics
 (PR metrics pending)

説明

Topic

CNVs analysis using Sarek

Tasks to realise the tutorial

  1. identify appropriate software
  2. simulate CNV data (max size 100Mb each)
  3. prepare gitpod / codespaces environment and build code
  4. prepare theoretical intro
  5. write down hands-on tutorial

コントリビューターガイド

調査方針
タスクリストに従って、適切なCNV検出ソフトウェアを特定し、CNVデータをシミュレートし（各最大100MB）、Gitpod/Codespaces環境を準備してコードを構築し、理論的な導入を準備し、ハンズオンチュートリアルを作成します。
技術スタック
なし
領域
data
Issue 種別
ドキュメント
難度新しい貢献者にとっての実装難度です。1 は非常に小さな変更、5 は専門的な作業です。
1
推定時間経験ある貢献者が調査、実装、テスト、pull request 準備にかけるおおよその時間範囲です。
半日
活動状況Issue が今どれだけ取り組みやすいかを示します。新しい、活発、古い、ブロック中、またはメンテナー入力待ちなどです。
新着
明確さ期待される変更、受け入れ条件、次の手順がどれだけ明確かを示します。
明確
前提条件
Git
初心者向け度初回貢献者にどれだけ取り組みやすいかを 1-100 で推定したスコアです。
90