Get rid of checksamplesheet.py and switch to nf-schema
評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 25/100
- issue の種類
- リファクタリング
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 停滞
調査の方向性
現在のパイプラインテンプレートとその nf-validation セットアップを確認し、要求されている nf-schema の機能を既存の checksamplesheet.py ワークフローと比較します。テンプレートが nf-schema をサポートし、パイプラインが検証に checksamplesheet.py を依存しなくなれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Description of feature
As requested here, the pipeline should switch to nf-schema. As the validation needs to use features of nf-schema and the current template still uses nf-validation, this will be implemented once nf-schema is included in the template.
- 主要言語
- Nextflow
- スター
- 245
- フォーク
- 185
- 平均マージ
- 6分
- マージ済み PR（30日）
- 1
環境構築
このプロジェクトの開発コンテナを、あなたの GitHub アカウントでブラウザ上に起動します。
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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