NWB export function
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評価
調査の方向性
まず、前身プロジェクトの datajoint_to_nwb.py にあるパイプラインを読み、試行データのエクスポート機構を、issue でリンクされている ndx-events の作業と比較します。ここに示されている session.Session、trial.TrialEvent、trial_to_nwb のエントリーポイントを確認します。完了とは、試行データセットを NWB に同様にエクスポートする方法について合意し、実装することを意味しますが、issue では必要なフィールドやテストは定義されていません。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
A precursor project established a mechanism for exporting trial data sets to NWB. We should incorporate something similar. NWB developers have released similar work for ndx-events.
from pynwb import NWBFile
from element_session import session
from element_trial import trial
def trial_to_nwb(trial_key):
trial_query = session.Session & trial.TrialEvent & trial_key
# more
return NWBFile(trial_query)
- 主要言語
- Python
- スター
- 2
- フォーク
- 18
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートなし
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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