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datajoint

索引済みのリポジトリ 31 件 · GitHub で見る

datajoint-python
Relational Workflows: where database schemas define executable data pipelines.

Python · スター 197 個
datajoint-matlab
Relational data pipelines for the science lab

MATLAB · スター 41 個
mysql-docker
Docker image for MySQL configured to work with DataJoint

Shell · スター 18 個
element-calcium-imaging
DataJoint Element for multi-photon calcium imaging analysis with CaImAn, Suite2p, and EXTRACT

Jupyter Notebook · スター 16 個
element-deeplabcut
DataJoint Element for behavioral analysis with DeepLabCut

Jupyter Notebook · スター 13 個
datajoint-tutorials
Getting started materials for DataJoint - with Calcium Imaging, Electrophysiology, Machine Learning examples

Jupyter Notebook · スター 13 個
datajoint-labbook
DataJoint LabBook is a graphical user interface built using React to facilitate working with DataJoint computational pipelines.

TypeScript · スター 12 個
element-array-ephys
DataJoint Element for Neuropixels analysis with Kilosort

Jupyter Notebook · スター 10 個
mym
MySQL API for MATLAB with support for BLOB objects

C · スター 8 個
sci-viz
Generic visualization framework for building dashboarding capabilities for DataJoint pipelines.

TypeScript · スター 7 個
datajoint-docs
Landing Page for DataJoint Documentation

Jupyter Notebook · スター 7 個
compress-multiphoton
Compression for multiphoton calcium imaging movies and stacks

Jupyter Notebook · スター 6 個
element-moseq
DataJoint Element for Motion Sequencing with Keypoint-MoSeq

Jupyter Notebook · スター 5 個
element-facemap
DataJoint Element for behavioral analysis with Facemap

Jupyter Notebook · スター 3 個
element-miniscope
DataJoint Element for miniscope calcium imaging analysis with CaImAn

Jupyter Notebook · スター 3 個
pharus
Pharus is a generic REST API server backend for DataJoint pipelines built on top of flask, datajoint, and pyjwt.

Python · スター 3 個
djlabhub-docker
A docker image optimized for deploying to JupyterHub a JupyterLab environment with DataJoint Python.

Python · スター 3 個
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Common functions for the DataJoint Elements

Python · スター 3 個
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DataJoint Element for event-based behavior experiments

Python · スター 2 個
element-animal
DataJoint Element for animal management

Python · スター 1 個
ほか 11 件のリポジトリは GitHub で見るにあります

初心者向けすべて

オープンすべて

dj.Diagram SVG output is not byte-reproducible: set iteration order leaks into node emission order オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 78/100

datajoint/datajoint-python#1551 · 2026年9月9日に作成
Store the entire figpack bundle as the object, not just data.zarr オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 57/100

datajoint/dj-figpack-codecs#7 · 2026年9月4日に作成
Codec encode/decode: separate connection context from primary key in the `key` argument オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/datajoint-python#1550 · 2026年9月3日に作成
Add a hidden `_prov` attribute for extrinsic provenance at pipeline boundaries オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/datajoint-python#1547 · 2026年8月20日に作成
Rename the table tiers to a consistent axis — `dj.Entry`, `dj.Ingest`, `dj.Compute` (keep `Manual`/`Imported`/`Computed` as permanent aliases) オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 52/100

datajoint/datajoint-python#1546 · コメント 1 件 · 2026年8月20日に作成
Explain the tier-naming axis: `Manual` means external-origin, not hand-entered オープン

datajoint/datajoint-docs#267 · コメント 9 件 · 担当者 1 名 · 2026年8月20日に作成
Reference specs: document signal handling in populate() (SIGTERM mechanics) オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 84/100

datajoint/datajoint-docs#262 · 2026年8月18日に作成
dj.Diagram theme: make the font configurable オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 76/100

datajoint/datajoint-python#1539 · コメント 3 件 · 2026年8月11日に作成
Migrate to DataJoint 2.x (no blobs — import break and native numeric types) オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 52/100

datajoint/element-electrode-localization#34 · 2026年8月8日に作成
Migrate to DataJoint 2.x: 6 longblob attributes silently corrupt data オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 55/100

datajoint/element-zstack#23 · 2026年8月8日に作成
Migrate to DataJoint 2.x: 4 attributes fail to declare, 1 longblob attribute silently corrupts data オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 64/100

datajoint/element-optogenetics#18 · 2026年8月8日に作成
Migrate to DataJoint 2.x: 20 attributes fail to declare, 8 longblob attributes silently corrupt data オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 52/100

datajoint/element-moseq#24 · 2026年8月8日に作成
Migrate to DataJoint 2.x: 28 longblob attributes silently corrupt data オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 55/100

datajoint/element-miniscope#68 · 2026年8月8日に作成
Migrate to DataJoint 2.x: 9 longblob attributes silently corrupt data オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

datajoint/element-deeplabcut#145 · 2026年8月8日に作成
Migrate to DataJoint 2.x: 14 longblob attributes silently corrupt data, 1 attribute fails to declare オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 58/100

datajoint/element-array-ephys#230 · 2026年8月8日に作成
FacialSignal.MotionSVD is built from the wrong array axis, and empty motSv raises IndexError オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 72/100

datajoint/element-facemap#46 · コメント 2 件 · 2026年8月6日に作成
longblob silently stores str(array) under DataJoint 2.x — 16 affected attributes, no error raised オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/element-facemap#45 · コメント 4 件 · 2026年8月6日に作成
longblob silently stores str(array) under DataJoint 2.x — 2 affected attributes, no error raised オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/element-session#43 · コメント 2 件 · 2026年8月6日に作成
longblob silently stores str(array) under DataJoint 2.x — 3 affected attributes, no error raised オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/element-event#48 · コメント 2 件 · 2026年8月6日に作成
element-animal cannot be imported under DataJoint 2.x (dj.schema removed; boolean and double-quoted enum rejected) オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/element-animal#52 · コメント 3 件 · 2026年8月6日に作成
longblob silently stores str(array) under DataJoint 2.x — 30 affected attributes, no error raised オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 38/100

datajoint/element-calcium-imaging#206 · コメント 3 件 · 2026年8月6日に作成
Make key_source restrict-only: add key_source_restriction, deprecate parent-redefining overrides オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/datajoint-python#1523 · コメント 1 件 · 2026年7月24日に作成
Support storing extension-based views (ExtensionView / PlotlyFigure) オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/dj-figpack-codecs#4 · コメント 1 件 · 2026年7月22日に作成
FigpackRef.load()/show() broken on DataJoint 2.3 (remote get_folder AttributeError; file branch caches None) オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

datajoint/dj-figpack-codecs#3 · 2026年7月22日に作成
Diagram.restrict: apply Part conditions through the Master to preserve master-part compositional integrity オープン

enhancement stale

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 52/100

datajoint/datajoint-python#1501 · コメント 2 件 · 2026年7月16日に作成
Cascade delete: a restriction referencing an earlier-deleted (downstream) table is silently invalidated by reverse-topological delete order — materialize (independent of MySQL 1093) オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

datajoint/datajoint-python#1496 · コメント 1 件 · 2026年7月15日に作成
Diagram.trace: descend through master-part boundaries (Merge-table upstream tracing) オープン

enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/datajoint-python#1481 · コメント 1 件 · 2026年7月4日に作成
Trustworthy garbage collection: complete reference discovery (#1469) + race-safe deletion (#1445) オープン

enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/datajoint-python#1478 · コメント 5 件 · 2026年7月2日に作成
ProcessingQualityMetrics duplicates masks for multi-field scans オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 68/100

datajoint/element-calcium-imaging#204 · 2026年5月19日に作成
Please make a new release to be able to use ghtb with the new mym update オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

datajoint/mym#103 · コメント 1 件 · 2026年5月15日に作成
Two-phase, transaction-safe garbage collection (quarantine -> grace -> purge) オープン

enhancement

datajoint/datajoint-python#1445 · コメント 3 件 · 担当者 1 名 · 2026年4月30日に作成
Unable to update records when datetime is in primary key オープン

bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 42/100

datajoint/pharus#181 · 2025年12月4日に作成
Docker Support for Testing and Development (client) オープン

enhancement

datajoint/element-deeplabcut#144 · 担当者 1 名 · 2025年11月26日に作成
Multi-Animal Individual Support in PoseEstimation オープン

enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/element-deeplabcut#143 · 2025年11月26日に作成
Support multi-animal pretrained models in DataJoint DeepLabCut Element オープン

enhancement

datajoint/element-deeplabcut#141 · コメント 1 件 · リアクション 4 件 · 担当者 1 名 · 2025年11月5日に作成
Hostile takeover of bash shell even after cleansing miniconda3 from system オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

datajoint/miniconda3-docker#51 · 2025年9月24日に作成
Feature Request: Support for ms_delay in ScanSet.UnitInfo オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/element-calcium-imaging#203 · 2025年5月27日に作成
Use ROR for organizations and ORCID for researchers. オープン

enhancement

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/element-lab#48 · 2024年9月27日に作成
Update tests to also run on Python 3.9-3.12 like `datajoint/datajoint-python` オープン

enhancement

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

datajoint/element-array-ephys#207 · 2024年9月27日に作成
`ProbeType.create_neuropixels_probe` warning message improvements オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/element-array-ephys#206 · 2024年9月27日に作成
Error using non-ASCII table name オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 15/100

datajoint/mym#102 · 2024年8月14日に作成
mym for apple silicon オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

datajoint/mym#100 · 2024年3月30日に作成
Need to compile mym for Native Apple Silicon Matlab オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/mym#99 · 2024年3月14日に作成
Allow pasting when logging into a database オープン

awaiting-triage enhancement

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

datajoint/datajoint-matlab#437 · 2024年2月21日に作成
MATLAB hangs and ramps up CPU usage if user closes the password Diagloue Box オープン

awaiting-triage bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/datajoint-matlab#436 · 2024年2月21日に作成
Adding New Acquisition Software, ThorImage オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

datajoint/element-calcium-imaging#179 · 2024年1月30日に作成
Pixel size for test data オープン

datajoint/compress-multiphoton#12 · 担当者 1 名 · 2023年11月16日に作成
Add 404 error handling where necessary オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

datajoint/pharus#169 · 2023年9月29日に作成
add recording key restraint to model.get_trajectory オープン

bug

datajoint/element-deeplabcut#82 · コメント 1 件 · 担当者 2 名 · 2023年7月28日に作成
Add capabilities for populate, and uploading/downloading data directly in labbook オープン

enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

datajoint/datajoint-labbook#176 · 2023年6月26日に作成

datajoint

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