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NWB export function

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
data

Direzione di ricerca

Inizia leggendo la pipeline del progetto predecessore in datajoint_to_nwb.py e confrontando il suo meccanismo di esportazione dei dati delle prove con il lavoro su ndx-events collegato nell’issue. Esamina gli entry point session.Session, trial.TrialEvent e trial_to_nwb mostrati qui. Il lavoro sarebbe completato concordando e implementando un’esportazione simile dei dataset delle prove in NWB, ma l’issue non definisce i campi o i test richiesti.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement NWB

A precursor project established a mechanism for exporting trial data sets to NWB. We should incorporate something similar. NWB developers have released similar work for ndx-events.

from pynwb import NWBFile
from element_session import session
from element_trial import trial


def trial_to_nwb(trial_key):
    trial_query = session.Session & trial.TrialEvent & trial_key
    # more
    return NWBFile(trial_query)
Lingua principale
Python
Stelle
2
Fork
18
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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