Observation and Fix: Sqlalchemy 2.0 Compatibility - Downgrade to Sqlalchemy 1.x

オープン
#33 コメント 0 件 リアクション 1 件 担当者 0 名 GitHub で見る

まだ誰も着手していません。

評価

難易度
3/5
見積もり時間
1〜2日
初心者へのやさしさ
45/100
issue の種類
バグ
明瞭さ
おおむね明確
活発さ
停滞
技術スタック
python, sqlalchemy
領域
databases

調査の方向性

まず、SQLAlchemy 2.0 を使用した Miniforge のインストールで発生するランタイムエラーを再現し、次に削除された Engine.execute() API の使用箇所を特定します。ダウングレードを必要とせずにアプリケーションが SQLAlchemy 2.0 で動作することを確認します。この issue では具体的なファイルやテストは指定されていません。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

Just for information and to help other users of Biophi:

I installed Biophi using miniforge by following instructions provided on the project's github page.
However there was a runtime error:
AttributeError: 'Engine' object has no attribute 'execute'

I could track the issue down to a change in Sqlalchemy 2.0. Downgrading to Sqlalchemy via conda did the trick:
https://docs.sqlalchemy.org/en/14/changelog/migration_20.html
It is about engine.execute() which was deprecated in 1.4 and removed in 2.0.

$ conda install "sqlalchemy<2.0"
That installed sqlalchemy-1.4.46.

Kind regards and many thanks for providing Biophi, a great application!

主要言語
Python
スター
269
フォーク
65
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

環境構築

  • Dockerfile または Docker Compose ファイルあり
  • プルリクエストのテンプレートなし
  • コントリビューションガイドなし

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

Merck/BioPhi のほかの issue

Merck/BioPhi の issue をすべて見る

似ている issue

Python の issue をもっと見る

新しい issue をメールで受け取る

初心者向けの GitHub issue を短くまとめたダイジェスト。