Observation and Fix: Sqlalchemy 2.0 Compatibility - Downgrade to Sqlalchemy 1.x
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Evaluación
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Aptitud para principiantes
- 45/100
Línea de trabajo
Comienza reproduciendo el error de ejecución de la instalación de Miniforge con SQLAlchemy 2.0 y, a continuación, localiza el uso de la API eliminada Engine.execute(). Confirma que la aplicación funciona con SQLAlchemy 2.0 sin requerir una degradación; el issue no menciona archivos ni pruebas específicos.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Just for information and to help other users of Biophi:
I installed Biophi using miniforge by following instructions provided on the project's github page.
However there was a runtime error:
AttributeError: 'Engine' object has no attribute 'execute'
I could track the issue down to a change in Sqlalchemy 2.0. Downgrading to Sqlalchemy via conda did the trick:
https://docs.sqlalchemy.org/en/14/changelog/migration_20.html
It is about engine.execute() which was deprecated in 1.4 and removed in 2.0.
$ conda install "sqlalchemy<2.0"
That installed sqlalchemy-1.4.46.
Kind regards and many thanks for providing Biophi, a great application!
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 268
- Forks
- 65
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
- Incluye un Dockerfile o un archivo de Docker Compose
- Sin plantilla de pull request
- Sin guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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