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BlueBrain

索引済みのリポジトリ 39 件 · GitHub で見る

nexus
Blue Brain Nexus - A knowledge graph for data-driven science

Scala · スター 301 個
NeuroMorphoVis
A lightweight, interactive, extensible and cross-platform framework for building, visualizing and analyzing digital reconstructions of ne...

Python · スター 138 個
nexus-forge
Building and Using Knowledge Graphs made easy

Python · スター 52 個
Tide
Tiled Interactive Display Environment

C++ · スター 50 個
VessMorphoVis
A lightweight, interactive, extensible and cross-platform framework for building, visualizing and analyzing vasculature (or blood vessels...

Python · スター 50 個
MOOC-neurons-and-synapses-2017
Reference data for the "Simulation Neuroscience:Neurons and Synapses" Massive Online Open Course

Jupyter Notebook · スター 44 個
Ultraliser
Reconstruction of watertight meshes, annotated volumes and center line skeletons of neuroscience spatial structures from non-watertight i...

C++ · スター 36 個
BlueGraph
Python framework for graph analytics and co-occurrence analysis

Python · スター 34 個
Deflect
C++ library for building applications to stream pixels to Tide

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Brion
Blue Brain C++ File IO Library

C++ · スター 23 個
Atlas-Download-Tools
Search, download, and prepare brain atlas data.

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EModelRunner
Runs cells from stand-alone packages.

Python · スター 16 個
BluePyMM
Blue Brain Python Cell Model Management

Python · スター 13 個
atlas-alignment
Blue Brain multi-modal registration and alignment toolbox

Python · スター 12 個
morphoclass
Neuronal morphology preparation and classification using Machine Learning.

Python · スター 12 個
MOOC-hippocampus-network-simulation-2019

Jupyter Notebook · スター 11 個
Long-range-micro-connectome
BlueBrain's recipe writer to parameterize structure and logic of a mouse whole-neocortex connectome

Python · スター 10 個
hpc-coding-conventions

Python · スター 10 個
nexus-bbp-domains
BBP domains specification (schemas, vocabularies)

Scala · スター 9 個
ccfv3a-extended-atlas

Python · スター 9 個
ほか 19 件のリポジトリは GitHub で見るにあります

初心者向けすべて

オープンすべて

missing file in Windows install オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

BlueBrain/NeuroMorphoVis#219 · コメント 2 件 · 2026年6月8日に作成
Regarding course Jupyter notebook オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

BlueBrain/MOOC-neurons-and-synapses-2017#106 · 2026年5月17日に作成
Operator Advisory: GitHub Discussions must be enabled to start the pipeline オープン

難易度 1/5 1時間未満初心者へのやさしさ 20/100

BlueBrain/Molsys-transcriptomic-atlas#1 · 2026年3月27日に作成
Thank you オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 1/100

BlueBrain/dir-content-diff#79 · コメント 4 件 · リアクション 1 件 · 2025年8月20日に作成
spinal cord part data in QuickNII or BrainGlobe platform missing オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/ccfv3a-extended-atlas#1 · 2025年6月2日に作成
Voxelization Error in Blender 4.2.3 オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/NeuroMorphoVis#218 · コメント 4 件 · 2025年2月20日に作成
recompiling the sphinx docs fails (neurodamus) オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

BlueBrain/sphinx-bluebrain-theme#74 · 2025年1月30日に作成
Simulating the Hippocampus Microcircuits Brayns and App Recordings オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 20/100

BlueBrain/MOOC-neurons-and-synapses-2017#105 · コメント 1 件 · 2024年12月11日に作成
Mismatch between Assignment Scores obtained and overal grade オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 20/100

BlueBrain/MOOC-neurons-and-synapses-2017#104 · 2024年12月11日に作成
Can I show the running executable in Tide? オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

BlueBrain/Tide#320 · 2024年11月19日に作成
neuro オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 1/100

BlueBrain/MOOC-neurons-and-synapses-2017#103 · 2024年10月24日に作成
Needs to be updated to use `bluepysnap` and `brain-indexer` オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 15/100

BlueBrain/white-matter-projections#1 · 2024年10月16日に作成
Compute distance from spine base to the soma オープン

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#76 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2024年8月27日に作成
Classification of arbors into axons and dendrites. オープン

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#75 · 担当者 1 名 · 2024年8月27日に作成
Support loading PropertyShape-s in RdfModel オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

BlueBrain/nexus-forge#422 · 2024年8月20日に作成
Make a macOS App Installer オープン

enhancement

BlueBrain/NeuroMorphoVis#214 · 担当者 1 名 · 2024年8月19日に作成
Refactor the shading layer オープン

enhancement

BlueBrain/NeuroMorphoVis#213 · 担当者 1 名 · 2024年8月19日に作成
Soma analyzer オープン

bug enhancement

BlueBrain/NeuroMorphoVis#212 · 担当者 1 名 · 2024年8月19日に作成
Display the entire axon in the Morpholoy Toolbox オープン

bug enhancement

BlueBrain/NeuroMorphoVis#210 · 担当者 1 名 · 2024年8月18日に作成
When distribution contentType and File contentType mismatch, silently fails オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus-forge#421 · 2024年8月8日に作成
Error about Cytoscapeviz.pl: command not found オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

BlueBrain/basalt#115 · 2024年7月18日に作成
Catch all retrieval request failures into kgforge.core.commons.exception.RetrievalError オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus-forge#417 · 2024年7月8日に作成
Allow loading local schemas for testing validation オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

BlueBrain/nexus-forge#412 · コメント 1 件 · 2024年6月19日に作成
Add an endpoint to return schema dependencies オープン

delta enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#5028 · 2024年6月10日に作成
Deduplicate and add version validation of imports オープン

delta enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 42/100

BlueBrain/nexus#5027 · 2024年6月10日に作成
Keep track of schema and ontology import resolution オープン

delta enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 30/100

BlueBrain/nexus#5026 · 2024年6月10日に作成
Allow to deprecate directories オープン

delta feature

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

BlueBrain/nexus#4979 · 2024年5月15日に作成
Allow to tag directories オープン

delta feature

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

BlueBrain/nexus#4978 · 2024年5月15日に作成
Allow to update directories via an link operation オープン

delta feature

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

BlueBrain/nexus#4977 · 2024年5月15日に作成
Add a fetch endpoint for directories オープン

delta feature

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 38/100

BlueBrain/nexus#4976 · 2024年5月15日に作成
Introduce the Directory entity with a link operation オープン

delta feature

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4924 · 2024年5月2日に作成
Remove unnecessary polling of statistics endpoint オープン

fusion

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

BlueBrain/nexus#4913 · 2024年4月30日に作成
Advanced view disappears when user clicks "fold" in some cases オープン

fusion

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

BlueBrain/nexus#4905 · 2024年4月25日に作成
Implement a binary PLY mesh reader and exporter. オープン

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#71 · 担当者 1 名 · 2024年4月12日に作成
Invalid time since creation/update in resource metadata display オープン

bug fusion

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4835 · 2024年4月4日に作成
Traversing links in Fusion's advanced view of a resource resolves view in wrong bucket オープン

bug fusion

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

BlueBrain/nexus#4834 · 2024年4月4日に作成
Copying resource tags in fusion オープン

feature fusion

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4815 · 2024年4月2日に作成
Where can I find synaptic calcium concentration values in this simulation? オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

BlueBrain/EModelRunner#104 · コメント 1 件 · 2024年3月15日に作成
Add an endpoint to compare two resources オープン

delta feature

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4787 · リアクション 1 件 · 2024年3月7日に作成
Investigate if the largest projects can be benefit from further partitioning オープン

delta investigation

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4786 · 2024年3月7日に作成
As the user I want to display File/Image Resource and resources with image property in preview plugin オープン

enhancement fusion

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

BlueBrain/nexus#4761 · 2024年2月28日に作成
Dataset from Resource doesn't keep LazyActions オープン

bug Dataset

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 42/100

BlueBrain/nexus-forge#390 · 2024年2月27日に作成
Further coloring schemes for the analaysis. オープン

enhancement

BlueBrain/NeuroMorphoVis#207 · 担当者 1 名 · 2024年2月27日に作成
Remove the custom error / rejection handling for routes in Delta オープン

delta refactoring and maintenance

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4754 · 2024年2月23日に作成
Failed download does not set any _last_action オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

BlueBrain/nexus-forge#385 · 2024年2月19日に作成
User should be able to find resources when they search by id オープン

bug fusion

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

BlueBrain/nexus#4744 · 2024年2月19日に作成
Apply schema mapping to resources オープン

delta feature

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4704 · 2024年1月29日に作成
Introduce a schema mapping configuration オープン

delta feature

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4703 · 2024年1月29日に作成
Update morphologyviewer plugin in fusion オープン

fusion fusion-plugin

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4680 · 2024年1月22日に作成
Show count of triples when querying a sparql view オープン

feature fusion

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

BlueBrain/nexus#4668 · 2024年1月17日に作成

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