Handle worker abort better
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 初心者へのやさしさ
- 35/100
- issue の種類
- バグ
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- r
調査の方向性
Start by reproducing the bplapply(1:2, (...) q()) example and trace how BiocParallel handles a worker that does not deliver a result. Done means the abort produces an understandable user-facing error rather than the reducer$value.cache environment-subassignment error.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
When a worker aborts (e.g., out of memory?) the result is an error in BiocParallel code, rather than an error understandable by the user.
> bplapply(1:2, \(...) q())
Error in reducer$value.cache[[as.character(idx)]] <- values :
wrong args for environment subassignment
In addition: Warning message:
In parallel::mccollect(wait = FALSE, timeout = 1) :
1 parallel job did not deliver a result
- 主要言語
- R
- スター
- 69
- フォーク
- 32
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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