Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

Handle worker abort better

Aperta
#249 1 commento 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

Nessuno ha ancora preso questa issue.

Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
r
Ambito
distributed-systems

Direzione di ricerca

Start by reproducing the bplapply(1:2, (...) q()) example and trace how BiocParallel handles a worker that does not deliver a result. Done means the abort produces an understandable user-facing error rather than the reducer$value.cache environment-subassignment error.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

When a worker aborts (e.g., out of memory?) the result is an error in BiocParallel code, rather than an error understandable by the user.

> bplapply(1:2, \(...) q())
Error in reducer$value.cache[[as.character(idx)]] <- values :
  wrong args for environment subassignment
In addition: Warning message:
In parallel::mccollect(wait = FALSE, timeout = 1) :
  1 parallel job did not deliver a result
Lingua principale
R
Stelle
69
Fork
32
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Altre issue di Bioconductor/BiocParallel

Tutte le issue di Bioconductor/BiocParallel

Issue simili

Altre issue su R

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.