Write a nf-core/mag samplesheet generator for nf-core/seqsubmit
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Nessuno ha ancora preso questa issue.
Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
Inizia esaminando gli output di nf-core/mag e i requisiti del samplesheet di input per nf-core/seqsubmit. Identifica quali statistiche devono essere raccolte e come corrispondono tra le due pipeline. Il lavoro è completato quando un modulo genera un samplesheet completo per seqsubmit a partire dai risultati di nf-core/mag, con una validazione o dei test che dimostrino l’integrazione.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Description of feature
For future intagration with nf-core/mag pipeline we need a module that will collect all neccessary stats from mag pipeline and create an input samplesheet for seqsubmit.
Difficulty: Hard
- Lingua principale
- Nextflow
- Stelle
- 22
- Fork
- 11
- Merge medio
- 1g 4h
- PR unite (30g)
- 8
Preparare l'ambiente
Avvia il container di sviluppo del progetto nel browser, con il tuo account GitHub.
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Ha un modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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