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api request: asset blob id to asset/dandiset/version

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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
api

Direzione di ricerca

Inizia tracciando come DandiAPIClient espone get_dandisets(), get_versions() e get_assets(), e dove sono definite le richieste API. Confronta l’endpoint proposto assets/blob/{blob_id}/ con il flusso esistente dei metadati degli asset. Il lavoro è completato quando un ID blob restituisce i metadati del relativo asset, oltre a ogni dandiset e versione che lo contengono, senza scansionare tutti i dandiset.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

I need to build a map from asset blob id to dandiset(s). Currently, I am doing this by:

client = DandiAPIClient()

with shelve.open("asset_blob_to_dandiset") as db:
    for dandiset in tqdm(list(client.get_dandisets()), position=1):
        for version in tqdm(list(dandiset.get_versions()), position=2, leave=False):
            dandiset = client.get_dandiset(dandiset_id=dandiset.identifier, version_id=version.identifier)
            for asset in tqdm(list(dandiset.get_assets()), position=3, leave=False):
                blob_id = asset.zarr if ".zarr" in pathlib.Path(asset.path).suffixes else asset.blob
                db[blob_id] = dandiset.identifier

This works, but feels terrible inefficient because I really only need the map for a subset of assets, but since I don't know which dandisets they belong to I am forced to iterate over all of them in order to create a reverse map. It would be great if I could have an endpoint like assets/blob/{blob_id}/ which would return asset metadata. Ideally, this would include the ids of each dandiset that contains this asset and versions within each of those dandisets that contain this asset.

Lingua principale
Python
Stelle
29
Fork
37
Merge medio
1g 5h
PR unite (30g)
20

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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